More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2748 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  100 
 
 
390 aa  782    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  99.49 
 
 
390 aa  779    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  99.49 
 
 
418 aa  778    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  99.49 
 
 
418 aa  779    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  99.49 
 
 
390 aa  779    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  93.59 
 
 
390 aa  696    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  99.49 
 
 
390 aa  780    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  99.49 
 
 
433 aa  777    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  76.67 
 
 
390 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  76.67 
 
 
390 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  76.41 
 
 
390 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  74.53 
 
 
390 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  74.8 
 
 
390 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  75.07 
 
 
390 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  74.53 
 
 
390 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  73.99 
 
 
390 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  74.26 
 
 
390 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  59.31 
 
 
398 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 
390 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  57.95 
 
 
390 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  49.87 
 
 
391 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  52.25 
 
 
392 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  48.47 
 
 
394 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  47.7 
 
 
394 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  40.2 
 
 
405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 
385 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 
385 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 
385 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
390 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
385 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
378 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 
383 aa  153  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 
385 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  32.81 
 
 
386 aa  143  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
373 aa  137  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 
388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 
399 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 
385 aa  110  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
401 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
395 aa  109  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 
376 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 
500 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
394 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
500 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 
496 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 
394 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
398 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
492 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
816 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 
816 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 
825 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
823 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
389 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
385 aa  89.7  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
389 aa  89.7  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
806 aa  89.4  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
403 aa  89  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
799 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 
826 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
378 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
815 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
819 aa  83.6  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  29.18 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
806 aa  77  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  28.19 
 
 
822 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  22.58 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
984 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>