241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4504 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 397 aa  781    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  69.03 
 
 		 393 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  69.49 
 
 		 396 aa  521  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  65.56 
 
 		 393 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  68.97 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  66.16 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  67.44 
 
 		 396 aa  482  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  56.76 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  55.64 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  55.12 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  54.86 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  55.96 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  57.63 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  54.43 
 
 		 399 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  46.84 
 
 		 392 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  46.25 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  43.29 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  45.62 
 
 		 384 aa  282  7.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  42.89 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  42.89 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  44.3 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  46.46 
 
 		 379 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  44.44 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  46.19 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  44.53 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  44.39 
 
 		 386 aa  265  8e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  41.89 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  40.05 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  44.03 
 
 		 379 aa  259  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  43.98 
 
 		 380 aa  244  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  42.78 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  38.8 
 
 		 378 aa  239  9e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  39.37 
 
 		 387 aa  237  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  39.95 
 
 		 407 aa  233  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  40.15 
 
 		 399 aa  232  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  40.61 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  38.75 
 
 		 382 aa  226  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  36.41 
 
 		 386 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  36.16 
 
 		 389 aa  213  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  37.66 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1394  lipid-A-disaccharide synthase  40.92 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295043  normal  0.0154859 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  38.18 
 
 		 379 aa  209  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  38.14 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  37.85 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  34.21 
 
 		 376 aa  207  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  34.2 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  35.1 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  37.53 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  38.08 
 
 		 380 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 		 376 aa  203  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  35.25 
 
 		 382 aa  203  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  35.61 
 
 		 389 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  34.7 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  37.53 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  38.2 
 
 		 380 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  37.43 
 
 		 375 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  36.88 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  36.41 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  36.41 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  35.64 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  37.29 
 
 		 389 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  36.7 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  36.72 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  36.7 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  36.7 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5316  lipid-A-disaccharide synthase  37.23 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743741  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  34.46 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  38.95 
 
 		 390 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  36.13 
 
 		 376 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  36.42 
 
 		 379 aa  192  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  36.86 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  34.11 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  35.06 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 435 aa  187  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  35.23 
 
 		 385 aa  187  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  32.63 
 
 		 393 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  38.36 
 
 		 378 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  35.6 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  30.53 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  34.52 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  34.29 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  36.12 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  37.24 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  34.82 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  37.24 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  34.64 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  34.64 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  34.99 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.48 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  34.1 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  34.64 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  33.85 
 
 		 385 aa  183  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  35.38 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  35.39 
 
 		 384 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  35.68 
 
 		 382 aa  182  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  35.1 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  36 
 
 		 410 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  32.46 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  35.23 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  37.66 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>