More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1681 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
386 aa  761    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1846  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  77.99 
 
 
385 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000726333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4117  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  76.74 
 
 
385 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2565  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  75.81 
 
 
390 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3187  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  75.73 
 
 
395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4717  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  77.92 
 
 
388 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413844  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1341  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  78.08 
 
 
382 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.354944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4746  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.99 
 
 
392 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1775  tRNA synthetase class II (G H P and S)  53.54 
 
 
379 aa  335  7e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349459  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0804  tRNA synthetase class II (G H P and S)  52.5 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0821563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1499  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  45.05 
 
 
387 aa  282  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.355503  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2646  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  44.68 
 
 
378 aa  279  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  46.22 
 
 
392 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4934  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  43.9 
 
 
379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1777  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  44.96 
 
 
387 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253476  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4292  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  46.03 
 
 
380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  0.0362525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1498  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  44.7 
 
 
387 aa  272  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.694394  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0188  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.61 
 
 
376 aa  230  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0170  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.61 
 
 
376 aa  229  8e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.135886  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3018  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.38 
 
 
376 aa  229  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0420  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.35 
 
 
373 aa  229  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019387  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0404  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.5 
 
 
377 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133547  normal  0.0561317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0510  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.39 
 
 
373 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0121409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0465  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.94 
 
 
373 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5795  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.33 
 
 
372 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4680  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.67 
 
 
380 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0504  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.87 
 
 
363 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483735  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1924  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.52 
 
 
360 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3550  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.76 
 
 
365 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.370469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
484 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2954  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.76 
 
 
368 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.826684  normal  0.0199101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  31.47 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.35 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.54 
 
 
517 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  33.6 
 
 
479 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3952  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.55 
 
 
360 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 
484 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 
418 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  27.04 
 
 
380 aa  97.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.36 
 
 
418 aa  96.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
418 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 
421 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 
418 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 
418 aa  94.4  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
427 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 
431 aa  91.3  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 
419 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  25.98 
 
 
426 aa  90.1  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4470  histidyl-tRNA synthetase 2  29.29 
 
 
449 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  25.9 
 
 
419 aa  87  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  28.35 
 
 
389 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.13 
 
 
438 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  23.14 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.33 
 
 
445 aa  82.8  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 
439 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.86 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.73 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0923  Histidine--tRNA ligase  27.15 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00438339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.14 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.52 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.85 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  28.49 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.14 
 
 
438 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.26 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.25 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl366  histidyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.99 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.39 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.99 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.96 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.13 
 
 
434 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 
421 aa  76.6  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
509 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  33.56 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 
432 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 
519 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  26.11 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1480  tRNA synthetase class II (G H P and S)  25 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.69 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 
427 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  24.3 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1100  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.77 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>