More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0686 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 229 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  77.78 
 
 		 255 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  76.39 
 
 		 217 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  79.26 
 
 		 217 aa  320  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  71.24 
 
 		 227 aa  313  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  77.52 
 
 		 230 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  71.89 
 
 		 236 aa  288  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  64.68 
 
 		 218 aa  275  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  63.76 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  65.9 
 
 		 229 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  65.28 
 
 		 218 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  59.17 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  68.66 
 
 		 226 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  68.66 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  61.75 
 
 		 222 aa  258  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  62.96 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  60.83 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  61.11 
 
 		 221 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  61.11 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  60.65 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  58.8 
 
 		 217 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  57.6 
 
 		 220 aa  234  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  53 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  53 
 
 		 236 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  53 
 
 		 236 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  53 
 
 		 236 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 223 aa  211  7.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  50.23 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  52.31 
 
 		 221 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  49.31 
 
 		 223 aa  197  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 		 250 aa  197  9e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  49.31 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  48.85 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  47.47 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  46.3 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.47 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 		 224 aa  192  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  48.11 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  44.55 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  45.83 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  51.8 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  51.8 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  49.55 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  44.29 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  50.94 
 
 		 268 aa  185  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  43.98 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.24 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  49.53 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  44.24 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  50.72 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  44.91 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.66 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  44.55 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  50.9 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  45.97 
 
 		 455 aa  181  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  43.97 
 
 		 258 aa  181  7e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.6 
 
 		 280 aa  181  9.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  46.3 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  47.93 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  47.39 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  48.58 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  46.48 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  42.27 
 
 		 240 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  40.09 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.5 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  45.79 
 
 		 252 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  45.5 
 
 		 445 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  44.44 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  43.05 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.2 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  45.5 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2085  ABC transporter related  49.56 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  46.79 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  43.32 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  41.74 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  46.08 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  43.13 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  48.37 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  44.09 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  46.33 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  44.98 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  48.11 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1536  ABC transporter related  44.95 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.0345919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  44.98 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  41.47 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  43.64 
 
 		 233 aa  174  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  41.18 
 
 		 228 aa  174  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 		 240 aa  174  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  44.98 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001050  ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  44.29 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>