More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7256 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7256  oxidoreductase  100 
 
 		 448 aa  926    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4836  FAD dependent oxidoreductase  65.4 
 
 		 448 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3065  hypothetical protein  64.96 
 
 		 448 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0139193  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5280  FAD dependent oxidoreductase  63.39 
 
 		 448 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  45.43 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4751  FAD dependent oxidoreductase  46.95 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  41.93 
 
 		 448 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  40.13 
 
 		 448 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09750  putative oxidoreductase  34.68 
 
 		 439 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 439 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1374  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 		 443 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  32.88 
 
 		 438 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2818  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 439 aa  246  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2113  putative oxidoreductase protein  33.68 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0578145  normal  0.36209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5370  oxidoreductase-related protein  32.35 
 
 		 442 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1106  FAD dependent oxidoreductase  34.14 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 430 aa  192  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 453 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 453 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 472 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 473 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 425 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.93 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  25.69 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  25.69 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 428 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 465 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  30.07 
 
 		 473 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 433 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  27.65 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  27.74 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  25.35 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  27.65 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  25.22 
 
 		 462 aa  103  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  27.33 
 
 		 437 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  25.68 
 
 		 431 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  25.55 
 
 		 439 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  26.76 
 
 		 427 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 431 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 463 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 435 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  27.27 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  25.75 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 434 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 496 aa  98.2  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  26.76 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  26.92 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 424 aa  97.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 432 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 		 435 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  25.67 
 
 		 439 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  26.8 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  25.88 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 472 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 425 aa  94.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 475 aa  94  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  27.61 
 
 		 427 aa  93.6  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  25.06 
 
 		 437 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 430 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 456 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 456 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  23.78 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 434 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>