296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2934 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  100 
 
 		 158 aa  325  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  62.5 
 
 		 157 aa  187  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  64.03 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  58.22 
 
 		 168 aa  176  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  52.94 
 
 		 171 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  52.94 
 
 		 171 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 174 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 155 aa  161  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 184 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  29.92 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  30.09 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  31.53 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  32.48 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 193 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 213 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  29.91 
 
 		 213 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  27.15 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  27.15 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  29.1 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 219 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 195 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 184 aa  51.2  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  28.91 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  25.95 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>