152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0329 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  296  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  78.72 
 
 		 149 aa  231  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  78.72 
 
 		 149 aa  231  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  74.47 
 
 		 169 aa  215  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  62.5 
 
 		 151 aa  189  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  55.24 
 
 		 185 aa  181  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  55.24 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  55.24 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  45.27 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  42.55 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  46.15 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  39.01 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  42.22 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  36.62 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  44.44 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 142 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  34.75 
 
 		 146 aa  105  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  41.13 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  36.43 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  36.03 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  37.14 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  37.61 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  34.09 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  33.6 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  33.88 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  35.2 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  36.56 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  29.32 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  31.58 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  37.08 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  28.06 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  31.34 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  34.29 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  28.8 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  29.2 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  29.2 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  29.2 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  36.19 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  29.69 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  29.09 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  28.93 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  28.93 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  28.93 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  28.93 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  36.23 
 
 		 374 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  30.85 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  28.93 
 
 		 248 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  28.93 
 
 		 238 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  30.63 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  21.32 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.17 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2571  hypothetical protein  45.9 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163005  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  32.58 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  27.52 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  27.52 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  25.83 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  27.07 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  25.86 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  29.23 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  29.23 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  29.23 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  29.31 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  27.2 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  27.43 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 		 225 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  31.07 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  31.07 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  31.07 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  32.22 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  26.02 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  25.64 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  25.64 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1719  Uncharacterized protein possibly involved in aromatic compounds catabolism  42.59 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  27.42 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>