185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_A0031 on replicon NC_007411
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007411  Ava_A0031  phage integrase  100 
 
 		 361 aa  752    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5244  integrase family protein  81.72 
 
 		 366 aa  627  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0239  Phage integrase  34.96 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000242525  hitchhiker  0.00437263 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  28.3 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  28.62 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  25.4 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5760  integrase family protein  25.55 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  29.55 
 
 		 283 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  26.02 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 295 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  28.57 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  25.93 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  22.84 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0430  site-specific recombinase XerD-like  24.84 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00678047  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  21.63 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  24.22 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  22.89 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  25.71 
 
 		 716 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2347  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.01871 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  24.76 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  27.27 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1743  Phage integrase  30.63 
 
 		 270 aa  53.9  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2492  integrase family protein  30.7 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  24.31 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  27.05 
 
 		 285 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  22.56 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  23.08 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  26.96 
 
 		 332 aa  53.5  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  31.54 
 
 		 298 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  30.43 
 
 		 408 aa  52.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  26.37 
 
 		 704 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  23.88 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  30.43 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  26.37 
 
 		 704 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  23.88 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  23 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  23.88 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  23.88 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  31.67 
 
 		 286 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  26.53 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  26.34 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  26.77 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  22.94 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.92 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  23.62 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  26.77 
 
 		 312 aa  50.8  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  27.55 
 
 		 290 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  27.82 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 301 aa  50.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  30.25 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  25.2 
 
 		 306 aa  50.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  25 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  26.62 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  31.71 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  32.2 
 
 		 278 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  31.71 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  25.14 
 
 		 370 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  34.68 
 
 		 406 aa  50.1  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  28.64 
 
 		 291 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  25.69 
 
 		 302 aa  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 302 aa  49.7  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  26.75 
 
 		 332 aa  49.7  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.13 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  26.96 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2807  Phage integrase  26.19 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  24.29 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  25.4 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2540  integrase family protein  24.7 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  32.17 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3609  site-specific recombinase, phage integrase family  27.49 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608868  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  26.39 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  24.2 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  26.62 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.2 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  29.37 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  33.87 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  27.04 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  30.58 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  23.02 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  30.58 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  22.25 
 
 		 422 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  32 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  32.28 
 
 		 430 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  28.11 
 
 		 495 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  29.15 
 
 		 361 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  32.56 
 
 		 329 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.88 
 
 		 317 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  21.85 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  24.88 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  30.17 
 
 		 307 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  21.85 
 
 		 353 aa  46.6  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  31.93 
 
 		 319 aa  46.2  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  35.4 
 
 		 412 aa  46.2  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  22.89 
 
 		 588 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2237  site-specific recombinase XerD-like  32.43 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0311543  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  24.87 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  24.87 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3916  integrase family protein  30.77 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0254607  normal  0.244131 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>