More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0239 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0239  Phage integrase  100 
 
 		 360 aa  748    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000242525  hitchhiker  0.00437263 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0031  phage integrase  34.96 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5244  integrase family protein  31.77 
 
 		 366 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  29.08 
 
 		 289 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  26.67 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  27.22 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  30.7 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  30.7 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5760  integrase family protein  30.14 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  27.27 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  25.78 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  27.7 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  24.74 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  24.74 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  24.74 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  27.64 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  29.6 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  28.22 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  24.58 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.69 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.38 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.38 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.38 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.38 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.38 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  28.4 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.7 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.38 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0430  site-specific recombinase XerD-like  25.2 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00678047  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.47 
 
 		 284 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  25.08 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.88 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  23.75 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  33.33 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  27.69 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  23.15 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  28.95 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  29.41 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  27.18 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  30.91 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  27.18 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.46 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  22.7 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  23.23 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  33.12 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  28.22 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.1 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  30.05 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.6 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  25.64 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.6 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  22.11 
 
 		 295 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.33 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.6 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  25.25 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  29.03 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  27.93 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.78 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0056  phage integrase family protein  30.6 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  25.73 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2807  Phage integrase  27.91 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  33.96 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  28.19 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.4 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  32.28 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  23.92 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  27.14 
 
 		 608 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  23.12 
 
 		 292 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  24.83 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  22.58 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  28.36 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  23.46 
 
 		 311 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.37 
 
 		 324 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.02 
 
 		 329 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  24.21 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.37 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  36.07 
 
 		 304 aa  53.5  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.7 
 
 		 324 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  34.55 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3027  phage integrase family protein  32.2 
 
 		 343 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  25.16 
 
 		 342 aa  53.1  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  26 
 
 		 309 aa  53.1  0.000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  33.33 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  29.09 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  29.09 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  29.09 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  28.72 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  28.72 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  29.09 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  27.41 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  29.09 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.02 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.94 
 
 		 314 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  28.75 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  28.72 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  29.09 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>