62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0724 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  100 
 
 
432 aa  840    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  38.48 
 
 
626 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  35.15 
 
 
401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  32.93 
 
 
840 aa  171  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  40.74 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.75 
 
 
769 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  32.38 
 
 
491 aa  150  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  30.1 
 
 
404 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  32.19 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  31.88 
 
 
403 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  41.33 
 
 
200 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  30.55 
 
 
472 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  27.25 
 
 
528 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  31.43 
 
 
1131 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  29.36 
 
 
481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  28.77 
 
 
559 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  28.77 
 
 
553 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  29.45 
 
 
629 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  29.66 
 
 
391 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  28.96 
 
 
417 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  29.76 
 
 
940 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  27.7 
 
 
378 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  28.08 
 
 
938 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  29.19 
 
 
463 aa  87.8  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  29.1 
 
 
430 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  25.32 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  28.85 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  28.44 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  26.26 
 
 
870 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  24.27 
 
 
538 aa  80.5  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  25.07 
 
 
575 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  24.49 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  28.02 
 
 
439 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  25.38 
 
 
708 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  28.78 
 
 
429 aa  77  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  30.45 
 
 
917 aa  74.3  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  27.8 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  26.7 
 
 
471 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  28.5 
 
 
688 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  23.49 
 
 
502 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  34.93 
 
 
714 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  25 
 
 
436 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  27.63 
 
 
477 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  23.56 
 
 
501 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  24.04 
 
 
485 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  26.61 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.77 
 
 
1272 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.13 
 
 
1287 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  23.28 
 
 
450 aa  59.7  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  22.75 
 
 
1329 aa  59.7  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  32.28 
 
 
1862 aa  57.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  22.18 
 
 
669 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2882  regulatory protein FlaEY  26.61 
 
 
950 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0301569  normal  0.06195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  22.8 
 
 
1848 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  28.16 
 
 
2864 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  26.15 
 
 
4433 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  24.41 
 
 
513 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  23.58 
 
 
385 aa  50.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  22.13 
 
 
2068 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  23.96 
 
 
553 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  26.27 
 
 
1969 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  22.58 
 
 
2554 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>