More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4044 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  504  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  76.52 
 
 		 247 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  39.68 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  39.42 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  37.96 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  40.66 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 264 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  36.07 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  36.73 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  37.18 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  37.18 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  37.18 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  32.37 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  33.05 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 238 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  31.73 
 
 		 246 aa  92  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  36.28 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  32.85 
 
 		 284 aa  88.6  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.72 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  24.88 
 
 		 248 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.35 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 262 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  32.94 
 
 		 252 aa  85.1  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  26.89 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  26.77 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.38 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  29.18 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  31.19 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  26.42 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  29.1 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  28.22 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  29.07 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  28.52 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  33.33 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  28.15 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.39 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  34.53 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  21.29 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  28.87 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  29.58 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  27.92 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  30.17 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  31.65 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  27.23 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>