128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2421 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  44.29 
 
 		 2047 aa  971    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 3373 aa  6435    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  39.37 
 
 		 5203 aa  540  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  39.51 
 
 		 5166 aa  534  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  39.61 
 
 		 1243 aa  355  8e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  29.21 
 
 		 5517 aa  308  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  28.73 
 
 		 8918 aa  269  8e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  32.56 
 
 		 2604 aa  251  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  40.46 
 
 		 436 aa  198  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  31.54 
 
 		 2656 aa  195  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0546  hypothetical protein  34.88 
 
 		 571 aa  195  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  27.42 
 
 		 5544 aa  188  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  32.72 
 
 		 1337 aa  188  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  32.72 
 
 		 1337 aa  188  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  41.43 
 
 		 586 aa  178  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  27.53 
 
 		 2112 aa  174  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  29.02 
 
 		 733 aa  162  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  34.5 
 
 		 666 aa  162  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  33.92 
 
 		 1263 aa  161  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  26.11 
 
 		 1531 aa  149  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  30.66 
 
 		 2990 aa  140  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  22.59 
 
 		 3392 aa  132  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  22.67 
 
 		 3393 aa  125  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  33.97 
 
 		 1153 aa  116  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  33.97 
 
 		 1153 aa  116  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  32.99 
 
 		 1727 aa  110  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  28.87 
 
 		 2876 aa  109  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  37.84 
 
 		 965 aa  109  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  37.84 
 
 		 965 aa  109  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  21.45 
 
 		 3190 aa  108  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  22.69 
 
 		 3333 aa  106  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  33.33 
 
 		 733 aa  105  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  23.59 
 
 		 3486 aa  105  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1665 aa  105  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  28.84 
 
 		 1202 aa  100  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  24.21 
 
 		 1508 aa  97.8  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  32.65 
 
 		 1809 aa  96.7  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  28.67 
 
 		 2890 aa  95.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  22.53 
 
 		 2136 aa  91.3  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  27.95 
 
 		 1293 aa  90.1  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  22.24 
 
 		 3210 aa  90.5  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  33.49 
 
 		 892 aa  88.6  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  33.56 
 
 		 727 aa  88.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  22.04 
 
 		 3242 aa  85.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  35.14 
 
 		 3324 aa  83.2  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  27.19 
 
 		 1519 aa  79  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.85 
 
 		 753 aa  78.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  31.05 
 
 		 1129 aa  75.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  21.04 
 
 		 2179 aa  75.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  28.3 
 
 		 812 aa  74.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  24.8 
 
 		 882 aa  73.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  33.17 
 
 		 1504 aa  72.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  31.12 
 
 		 1150 aa  70.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  24.73 
 
 		 5298 aa  70.1  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  33.49 
 
 		 1537 aa  69.7  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  21.34 
 
 		 2272 aa  67.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  25.29 
 
 		 1804 aa  67  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  30.14 
 
 		 2713 aa  65.9  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1946 aa  65.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  35.15 
 
 		 3634 aa  64.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  34.88 
 
 		 382 aa  65.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  23.47 
 
 		 1108 aa  63.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  33.49 
 
 		 2912 aa  62.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  31.03 
 
 		 1168 aa  62.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  34.4 
 
 		 130 aa  61.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  29.09 
 
 		 900 aa  61.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3941  hypothetical protein  25.28 
 
 		 450 aa  58.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  29.95 
 
 		 382 aa  58.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0739  Cna B domain-containing protein  29.47 
 
 		 536 aa  58.2  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000604676  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1282  Cna B domain-containing protein  37.38 
 
 		 248 aa  57.8  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.204415  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  29.45 
 
 		 2474 aa  57.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1481  cobaltochelatase  21.81 
 
 		 2110 aa  57  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  29.6 
 
 		 870 aa  57  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  27.23 
 
 		 845 aa  55.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  33.65 
 
 		 436 aa  55.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  33.65 
 
 		 436 aa  55.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  50.77 
 
 		 917 aa  55.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  30.84 
 
 		 4896 aa  54.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0155  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.25 
 
 		 502 aa  54.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0658  putative adhesin precursor SprB  27.89 
 
 		 470 aa  55.1  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.335587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  36.45 
 
 		 320 aa  54.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.04 
 
 		 1336 aa  53.9  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  38.89 
 
 		 440 aa  53.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6955  hypothetical protein  34.45 
 
 		 396 aa  53.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  32.84 
 
 		 983 aa  53.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3936  Cna B domain-containing protein  34.03 
 
 		 330 aa  53.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0567855  normal  0.0675553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4941  hypothetical protein  37.76 
 
 		 845 aa  53.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0859388 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1314 aa  53.1  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  30.43 
 
 		 813 aa  53.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6958  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.96 
 
 		 371 aa  52.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  22.22 
 
 		 771 aa  52  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  32.32 
 
 		 690 aa  52  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0613  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1043 aa  52  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  46.91 
 
 		 807 aa  52.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  28.43 
 
 		 676 aa  52  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  29.67 
 
 		 2000 aa  52.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  32.95 
 
 		 738 aa  50.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0130  hypothetical protein  31.28 
 
 		 265 aa  50.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  46.15 
 
 		 4909 aa  50.4  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26640  putative collagen-binding protein  29.43 
 
 		 2148 aa  50.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189167 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>