15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0613 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0613  hypothetical protein  100 
 
 		 1043 aa  2137    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5310  hypothetical protein  24.6 
 
 		 803 aa  230  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1757  hypothetical protein  24.46 
 
 		 930 aa  215  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2860  hypothetical protein  26.22 
 
 		 932 aa  196  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1285  hypothetical protein  23.24 
 
 		 934 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2567  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1020 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980048 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0697  hypothetical protein  22.73 
 
 		 972 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.418548  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1213  hypothetical protein  21.73 
 
 		 908 aa  135  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1303  sporulation related  23.87 
 
 		 1096 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2872  hypothetical protein  28.63 
 
 		 876 aa  112  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0453  OmpA/MotB domain-containing protein  23.88 
 
 		 993 aa  110  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.164289  hitchhiker  0.000000000838864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10368  hypothetical protein  20.09 
 
 		 878 aa  67.8  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4918  hypothetical protein  27.37 
 
 		 880 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0265175  normal  0.302203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3056  hypothetical protein  25.48 
 
 		 874 aa  49.7  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.136617 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  24.87 
 
 		 804 aa  47.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>