225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2426 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 856 aa  1744    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00467654  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4837  putative dead/deah box helicase domain protein  30.21 
 
 		 849 aa  160  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.907663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1150  DEAD/DEAH box helicase-like  26.24 
 
 		 858 aa  160  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.794218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1455  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.56 
 
 		 430 aa  157  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.79 
 
 		 348 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.14 
 
 		 863 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0859  dead/deah box helicase domain protein  27.14 
 
 		 863 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000405293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0511  DEAD/DEAH box helicase  27.67 
 
 		 869 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396939  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19790  superfamily II helicase  28.74 
 
 		 852 aa  127  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.56 
 
 		 868 aa  125  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3112  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  28.54 
 
 		 828 aa  124  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.471561 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2029  helicase domain-containing protein  27.58 
 
 		 711 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4880  helicase domain protein  28.5 
 
 		 713 aa  95.5  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.756208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0781  helicase-like  25.07 
 
 		 699 aa  91.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137503  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1492  helicase domain protein  27.01 
 
 		 758 aa  91.3  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  26.44 
 
 		 693 aa  85.1  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  25.56 
 
 		 723 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1048  helicase domain protein  24.38 
 
 		 729 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.94 
 
 		 709 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  26.2 
 
 		 904 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.58 
 
 		 791 aa  78.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.93 
 
 		 756 aa  77  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  25.54 
 
 		 1465 aa  76.3  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1218  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.27 
 
 		 1053 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.853055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.99 
 
 		 799 aa  74.7  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0228  hypothetical protein  24.23 
 
 		 703 aa  74.3  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515095  normal  0.0720823 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.74 
 
 		 694 aa  73.6  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  24 
 
 		 874 aa  73.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  25.64 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1187  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.82 
 
 		 1056 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.5 
 
 		 739 aa  72  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.66 
 
 		 1085 aa  72  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.49 
 
 		 707 aa  71.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  30.11 
 
 		 1185 aa  71.2  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  23.09 
 
 		 1068 aa  70.9  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.13 
 
 		 708 aa  70.1  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  24.3 
 
 		 799 aa  68.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.38 
 
 		 706 aa  68.9  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.27 
 
 		 707 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.88 
 
 		 715 aa  68.2  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.81 
 
 		 747 aa  68.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.4 
 
 		 1054 aa  67.8  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  24.4 
 
 		 1054 aa  67.8  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 		 747 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.21 
 
 		 707 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 		 746 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5115  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  23.52 
 
 		 1205 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0221  helicase domain protein  25.34 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.447634  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  35 
 
 		 1175 aa  66.6  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  24.57 
 
 		 824 aa  66.6  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.27 
 
 		 700 aa  65.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  23.29 
 
 		 2157 aa  65.5  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3328  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.24 
 
 		 717 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.953553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  31.79 
 
 		 729 aa  64.7  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  34.53 
 
 		 1055 aa  64.7  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  30.59 
 
 		 760 aa  64.7  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  25.17 
 
 		 726 aa  64.7  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.78 
 
 		 984 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.63 
 
 		 951 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  36.36 
 
 		 872 aa  63.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  32.28 
 
 		 1293 aa  63.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.76 
 
 		 952 aa  63.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.28 
 
 		 1064 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  40.21 
 
 		 940 aa  63.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.32 
 
 		 1032 aa  62.4  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.4 
 
 		 800 aa  62.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  26.63 
 
 		 861 aa  62.4  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  36.73 
 
 		 916 aa  62.4  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  38.83 
 
 		 961 aa  62  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.89 
 
 		 861 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0285  putative DEAD/DEAH box helicase-like protein  23.54 
 
 		 1226 aa  62  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.98 
 
 		 950 aa  61.6  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.89 
 
 		 861 aa  62  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  35.59 
 
 		 908 aa  62  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  35.71 
 
 		 1003 aa  61.6  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  34.75 
 
 		 908 aa  61.6  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  36.63 
 
 		 936 aa  61.6  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3576  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.35 
 
 		 1048 aa  61.6  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  36 
 
 		 863 aa  61.6  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  22.37 
 
 		 712 aa  61.2  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  34.75 
 
 		 908 aa  61.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.63 
 
 		 921 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  35.35 
 
 		 967 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  33.96 
 
 		 972 aa  61.2  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.76 
 
 		 1166 aa  61.2  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  35.35 
 
 		 967 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.71 
 
 		 964 aa  60.8  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  37.25 
 
 		 953 aa  60.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.8 
 
 		 868 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.62 
 
 		 929 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.84 
 
 		 919 aa  60.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.73 
 
 		 990 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.5 
 
 		 709 aa  59.7  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.62 
 
 		 918 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.62 
 
 		 918 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  34.69 
 
 		 908 aa  60.1  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  37.23 
 
 		 909 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.62 
 
 		 918 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  28.12 
 
 		 1767 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  34.31 
 
 		 998 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>