More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1717 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1717  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 354 aa  686    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3296  3-dehydroquinate synthase  49.67 
 
 		 349 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126555  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1253  3-dehydroquinate synthase  49.08 
 
 		 353 aa  242  7e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0434  3-dehydroquinate synthase  43.27 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1664  3-dehydroquinate synthase  40.06 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.825748  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  45.86 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0964  3-dehydroquinate synthase  39.64 
 
 		 369 aa  206  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0995  3-dehydroquinate synthase  39.64 
 
 		 369 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  37.47 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  35.07 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  43.08 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  43.08 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  42.52 
 
 		 372 aa  202  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  35.97 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  38.33 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  43.55 
 
 		 375 aa  200  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0208  3-dehydroquinate synthase  45.54 
 
 		 391 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0205078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  41.39 
 
 		 359 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  44.49 
 
 		 368 aa  198  9e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  38.19 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  43.84 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1074  3-dehydroquinate synthase  36.52 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  35.42 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  39.69 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  38.38 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  39.88 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  42.36 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1673  3-dehydroquinate synthase  47.13 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.333487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  42.18 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2009  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160945 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  37.35 
 
 		 388 aa  193  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  38.87 
 
 		 359 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  42.31 
 
 		 367 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  44.33 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2951  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000482896  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 362 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 362 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 362 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 362 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  36.92 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 		 362 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  38.69 
 
 		 346 aa  192  7e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3037  3-dehydroquinate synthase  44.86 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  34.57 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  36.96 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4545  3-dehydroquinate synthase  44.59 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0210  3-dehydroquinate synthase  48.31 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.822446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  38.36 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2414  3-dehydroquinate synthase  43.46 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  33.98 
 
 		 369 aa  190  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0199  3-dehydroquinate synthase  47.94 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  41.2 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  44.77 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  36.92 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  41.08 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  38.85 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  41.1 
 
 		 615 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  44.09 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  39.19 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  43.18 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  37 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  38.06 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  42.38 
 
 		 381 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  36.31 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  41 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  41.76 
 
 		 358 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  37.13 
 
 		 369 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 354 aa  186  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  41.92 
 
 		 363 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  40.22 
 
 		 363 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  42.7 
 
 		 370 aa  186  7e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2390  3-dehydroquinate synthase  40.67 
 
 		 370 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  36.04 
 
 		 351 aa  186  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1280  3-dehydroquinate synthase  35.31 
 
 		 354 aa  185  9e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0188  3-dehydroquinate synthase  48.08 
 
 		 389 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.575872  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  37.82 
 
 		 368 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  41.98 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  37.71 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  38.15 
 
 		 368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  42.55 
 
 		 540 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  41.32 
 
 		 370 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  42.05 
 
 		 355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  40.13 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  42.34 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  43.32 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  42.47 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1514  3-dehydroquinate synthase  35.21 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  37.69 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  34.56 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  36.39 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  38.67 
 
 		 361 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  41.95 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2021  3-dehydroquinate synthase  39.81 
 
 		 370 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.990757  normal  0.0317478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  38.17 
 
 		 376 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>