97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0428 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0456  putative GAF sensor protein  97.16 
 
 		 423 aa  785    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0457  putative GAF sensor protein  96.69 
 
 		 423 aa  781    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0428  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 423 aa  827    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 		 1557 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 1419 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  36.14 
 
 		 581 aa  97.8  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 		 1184 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3001  putative PAS/PAC sensor protein  37.09 
 
 		 635 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  34.46 
 
 		 721 aa  79.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 865 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 709 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 601 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  32.12 
 
 		 723 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 601 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3023  putative GAF sensor protein  29.48 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.593055  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 543 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.06 
 
 		 688 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 557 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 882 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 912 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  33.14 
 
 		 956 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  31.68 
 
 		 765 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.67 
 
 		 585 aa  66.6  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  35.12 
 
 		 760 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 1171 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.73 
 
 		 860 aa  63.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  29.03 
 
 		 754 aa  63.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.73 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  30.36 
 
 		 757 aa  60.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  31.76 
 
 		 866 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 570 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4251  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 674 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  30.86 
 
 		 685 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 776 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 		 3470 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.62 
 
 		 1478 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  34.57 
 
 		 709 aa  56.6  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.28 
 
 		 743 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  29.81 
 
 		 1039 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  28.02 
 
 		 753 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  29.21 
 
 		 607 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  40.45 
 
 		 1432 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.14 
 
 		 553 aa  53.1  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 1043 aa  53.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  41.27 
 
 		 688 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0169  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  49.15 
 
 		 711 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00160079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 1711 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 647 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  25 
 
 		 618 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  30.1 
 
 		 562 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  33.12 
 
 		 583 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.1 
 
 		 707 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.03 
 
 		 702 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3631  signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 		 666 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0755  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 588 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.452305  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  24.87 
 
 		 574 aa  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.26 
 
 		 583 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.32 
 
 		 688 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  28.49 
 
 		 744 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 591 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.43 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.05 
 
 		 1480 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 592 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  28.04 
 
 		 730 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  26.2 
 
 		 932 aa  47.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 592 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0292  PAS  30 
 
 		 383 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  26.37 
 
 		 697 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4627  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 662 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622134  hitchhiker  0.00510111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  36.99 
 
 		 692 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 592 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  24.24 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 711 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  23.78 
 
 		 969 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.22 
 
 		 579 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.19 
 
 		 616 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 545 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 592 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  25.93 
 
 		 817 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  29.81 
 
 		 572 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  23.39 
 
 		 697 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0852  GAF sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1055 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 		 636 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  25.75 
 
 		 550 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3833  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.1 
 
 		 732 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.1 
 
 		 1332 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5204  GAF domain protein  36.43 
 
 		 389 aa  43.1  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.412194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.52 
 
 		 981 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  24.85 
 
 		 371 aa  43.1  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  25.3 
 
 		 693 aa  43.1  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  26.1 
 
 		 719 aa  43.1  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>