More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1858 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1858  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.13 
 
 
219 aa  268  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.33 
 
 
231 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.35 
 
 
218 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.01 
 
 
218 aa  258  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.17 
 
 
232 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.79 
 
 
215 aa  249  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  56.16 
 
 
224 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 
214 aa  248  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.13 
 
 
221 aa  248  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 
214 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 
214 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 
214 aa  246  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 
214 aa  246  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 
214 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 
214 aa  246  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 
214 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.88 
 
 
217 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.66 
 
 
214 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 
220 aa  245  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.19 
 
 
214 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.19 
 
 
214 aa  244  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.29 
 
 
223 aa  241  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.02 
 
 
217 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.3 
 
 
222 aa  238  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.13 
 
 
236 aa  237  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.02 
 
 
216 aa  236  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 
235 aa  235  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 
235 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.97 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.97 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.13 
 
 
221 aa  232  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.17 
 
 
223 aa  233  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.87 
 
 
218 aa  231  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.53 
 
 
247 aa  231  7.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.76 
 
 
220 aa  229  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.6 
 
 
238 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0712  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.53 
 
 
225 aa  229  4e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.5 
 
 
220 aa  228  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.77 
 
 
227 aa  228  8e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.16 
 
 
227 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.54 
 
 
223 aa  226  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.34 
 
 
211 aa  226  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.31 
 
 
235 aa  226  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.04 
 
 
226 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.91 
 
 
227 aa  224  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.36 
 
 
219 aa  224  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.7 
 
 
217 aa  224  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  56.54 
 
 
225 aa  224  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.27 
 
 
264 aa  224  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.15 
 
 
216 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
224 aa  223  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3710  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.57 
 
 
226 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0845805 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.77 
 
 
230 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 
221 aa  221  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.67 
 
 
224 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.05 
 
 
219 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.83 
 
 
229 aa  220  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.3 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2051  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.65 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.623176  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.22 
 
 
219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4448  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.34 
 
 
230 aa  219  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.47 
 
 
221 aa  219  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  51.18 
 
 
224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.9 
 
 
225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.53 
 
 
221 aa  218  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2395  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.58 
 
 
221 aa  216  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.46 
 
 
225 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.22 
 
 
243 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.02 
 
 
221 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
221 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.34 
 
 
225 aa  215  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.47 
 
 
225 aa  215  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.29 
 
 
222 aa  215  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0954  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.98 
 
 
227 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.47 
 
 
223 aa  215  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1167  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.93 
 
 
217 aa  215  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000257786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
225 aa  214  8e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2632  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.28 
 
 
217 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50.45 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.31 
 
 
221 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.09 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.13 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1777  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.85 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151739  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1205  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.2 
 
 
211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.85 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.67 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  51.5 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2597  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.28 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.943131  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1509  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 
218 aa  212  4.9999999999999996e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.61 
 
 
221 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  47.95 
 
 
265 aa  211  5.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.37 
 
 
221 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2572  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.69 
 
 
244 aa  211  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.712481  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.37 
 
 
221 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.63 
 
 
221 aa  211  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3557  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.02 
 
 
228 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0333  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.34 
 
 
216 aa  210  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.540612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  47.93 
 
 
221 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>