More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2555 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
254 aa  502  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  58.55 
 
 
254 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  61.37 
 
 
254 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.44 
 
 
252 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.44 
 
 
252 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.96 
 
 
252 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.78 
 
 
252 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  55.7 
 
 
266 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.39 
 
 
244 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.58 
 
 
237 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  57.46 
 
 
257 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.83 
 
 
251 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.83 
 
 
252 aa  255  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  53.97 
 
 
255 aa  254  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.39 
 
 
254 aa  252  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.95 
 
 
254 aa  250  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.46 
 
 
245 aa  249  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.51 
 
 
255 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.07 
 
 
252 aa  248  5e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  50.57 
 
 
288 aa  245  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  52.81 
 
 
260 aa  244  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  46.86 
 
 
246 aa  244  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.05 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  52.97 
 
 
247 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  56.33 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.22 
 
 
252 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  51.07 
 
 
245 aa  241  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  50.42 
 
 
243 aa  241  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  51.54 
 
 
240 aa  240  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  53.98 
 
 
259 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  53.98 
 
 
259 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  51.69 
 
 
247 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  51.72 
 
 
247 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  51.97 
 
 
252 aa  239  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.72 
 
 
247 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.46 
 
 
260 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  56.14 
 
 
267 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  50.2 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.88 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  53.07 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 
249 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
249 aa  239  5e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.88 
 
 
249 aa  238  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.21 
 
 
256 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  51.11 
 
 
259 aa  237  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  46.81 
 
 
248 aa  237  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2593  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.87 
 
 
249 aa  237  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0126809  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1462  undecaprenyl diphosphate synthase  57.64 
 
 
259 aa  237  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.101817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  52.32 
 
 
261 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  54.78 
 
 
259 aa  237  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.46 
 
 
248 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.4 
 
 
259 aa  236  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  51.88 
 
 
251 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  51.46 
 
 
251 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  51.46 
 
 
251 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.88 
 
 
249 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
264 aa  236  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.61 
 
 
267 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
253 aa  235  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.19 
 
 
246 aa  234  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.32 
 
 
248 aa  234  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  53.51 
 
 
248 aa  234  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  50 
 
 
266 aa  235  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  47.28 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.3 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  51.05 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.5 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.28 
 
 
264 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
238 aa  232  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
264 aa  233  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 
256 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  50.22 
 
 
264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.5 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  50.63 
 
 
251 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.44 
 
 
258 aa  232  5e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.31 
 
 
267 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
253 aa  232  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
253 aa  232  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
246 aa  231  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.52 
 
 
275 aa  231  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.85 
 
 
238 aa  231  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
255 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
272 aa  231  9e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  46.86 
 
 
246 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  53.07 
 
 
260 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  51.75 
 
 
251 aa  230  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  53.51 
 
 
260 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
251 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.52 
 
 
275 aa  230  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.52 
 
 
275 aa  230  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  47.11 
 
 
275 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  47.11 
 
 
275 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  47.11 
 
 
275 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>