164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0166 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  100 
 
 
1319 aa  2525    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  32.99 
 
 
1441 aa  246  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  32.99 
 
 
1463 aa  241  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  32.82 
 
 
1463 aa  239  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  34.53 
 
 
1428 aa  236  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  32.98 
 
 
1451 aa  233  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  30.47 
 
 
2032 aa  230  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  28.45 
 
 
1538 aa  230  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  30.04 
 
 
2140 aa  228  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  33.69 
 
 
1423 aa  223  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  31.01 
 
 
1869 aa  217  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  31.31 
 
 
1404 aa  216  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  30.51 
 
 
1487 aa  209  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  24.38 
 
 
1550 aa  209  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  30.05 
 
 
1489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  31.23 
 
 
1530 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  26.65 
 
 
1510 aa  182  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  29.44 
 
 
1276 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  26.48 
 
 
1515 aa  180  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  32.23 
 
 
1424 aa  180  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  31.52 
 
 
1276 aa  179  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  31.18 
 
 
1276 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  31.01 
 
 
1448 aa  174  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  28.06 
 
 
1405 aa  171  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  28.39 
 
 
1578 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  27.05 
 
 
1462 aa  155  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  32.16 
 
 
1783 aa  152  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  29.54 
 
 
1395 aa  152  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  31.24 
 
 
1084 aa  152  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  31.65 
 
 
1396 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  26.33 
 
 
1501 aa  148  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  27.48 
 
 
1550 aa  145  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  32.85 
 
 
1398 aa  144  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  28.33 
 
 
1448 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  30.63 
 
 
1392 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  28.73 
 
 
1270 aa  131  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  32.72 
 
 
1937 aa  129  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  31.23 
 
 
1335 aa  128  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  25.94 
 
 
1362 aa  117  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  30.75 
 
 
1406 aa  116  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  28.86 
 
 
1206 aa  106  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  28.49 
 
 
1224 aa  95.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  28.33 
 
 
1224 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  27.36 
 
 
1352 aa  92.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  28.33 
 
 
1206 aa  92.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  27.91 
 
 
1223 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  22.95 
 
 
1308 aa  87.8  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.31 
 
 
1184 aa  88.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.31 
 
 
1184 aa  88.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  26.27 
 
 
1401 aa  86.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  27.62 
 
 
1232 aa  83.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  27.85 
 
 
1226 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  25.93 
 
 
1246 aa  82.8  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  26.46 
 
 
1453 aa  82.8  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  27.11 
 
 
1249 aa  82  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  25.46 
 
 
1229 aa  81.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  25.62 
 
 
1377 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  25.13 
 
 
1226 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  23.37 
 
 
1265 aa  80.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  27.46 
 
 
1224 aa  78.6  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  26.89 
 
 
1056 aa  78.2  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  26.96 
 
 
1243 aa  77.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  29.13 
 
 
1292 aa  76.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  25.47 
 
 
1305 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  24.85 
 
 
1258 aa  75.5  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  26.13 
 
 
1434 aa  74.3  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  24.36 
 
 
1507 aa  74.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  24.22 
 
 
1259 aa  72.4  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  26.96 
 
 
1297 aa  72.4  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  24.88 
 
 
1344 aa  72  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  24.22 
 
 
1259 aa  72  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  24.88 
 
 
1344 aa  72  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  27.73 
 
 
1218 aa  71.6  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  24.22 
 
 
1259 aa  71.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  24.88 
 
 
1341 aa  72  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  24.22 
 
 
1259 aa  71.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  24.88 
 
 
1344 aa  71.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  24.55 
 
 
1504 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  24.37 
 
 
1259 aa  70.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  23.58 
 
 
1259 aa  70.1  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  23.53 
 
 
1353 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  25.38 
 
 
1285 aa  70.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  24.43 
 
 
1273 aa  69.7  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  24.43 
 
 
1273 aa  70.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  23.58 
 
 
1259 aa  69.3  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  23.58 
 
 
1259 aa  69.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  23.58 
 
 
1259 aa  69.3  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  23.58 
 
 
1259 aa  69.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  25.83 
 
 
1319 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  23.58 
 
 
1259 aa  68.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  23.48 
 
 
857 aa  68.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  26.98 
 
 
1473 aa  68.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  22.88 
 
 
1310 aa  68.6  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  24.35 
 
 
1507 aa  68.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  23.4 
 
 
1259 aa  68.2  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  25.97 
 
 
1285 aa  68.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  24.41 
 
 
1290 aa  68.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  26.01 
 
 
1369 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  26.94 
 
 
1443 aa  67.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  23.4 
 
 
1259 aa  66.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>