More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4729 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 454 aa  904    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 459 aa  359  6e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  40.26 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  41.27 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  42.79 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  42.58 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  42.09 
 
 		 462 aa  342  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  42.17 
 
 		 454 aa  336  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  38.51 
 
 		 459 aa  335  7.999999999999999e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 462 aa  333  4e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  38.79 
 
 		 461 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  40.61 
 
 		 456 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 		 460 aa  326  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  38.9 
 
 		 461 aa  323  4e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  39.38 
 
 		 455 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 		 459 aa  320  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 		 459 aa  320  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  38.78 
 
 		 463 aa  316  5e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  38.51 
 
 		 450 aa  316  5e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  38.74 
 
 		 461 aa  315  8e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  45.47 
 
 		 446 aa  312  7.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  38.38 
 
 		 458 aa  310  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  40.39 
 
 		 462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  38.68 
 
 		 461 aa  310  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  38.96 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  38.96 
 
 		 458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  39.78 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  38.9 
 
 		 458 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  39.7 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  37.53 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  38.83 
 
 		 458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  38.94 
 
 		 447 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 446 aa  303  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  41.25 
 
 		 460 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 461 aa  302  9e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  36.31 
 
 		 472 aa  301  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 		 452 aa  301  2e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  37.28 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2599  tRNA modification GTPase TrmE  41.89 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.157289 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  41.97 
 
 		 461 aa  299  7e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  38.73 
 
 		 457 aa  299  8e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 448 aa  296  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  39.19 
 
 		 460 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  38.21 
 
 		 463 aa  295  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  38.72 
 
 		 464 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 467 aa  293  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  38.6 
 
 		 461 aa  293  4e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  39.17 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  38.28 
 
 		 460 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  37.97 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  38.28 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  36.9 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 		 458 aa  289  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 459 aa  289  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  38.03 
 
 		 473 aa  289  9e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  40.18 
 
 		 448 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  36.91 
 
 		 466 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  37.99 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  38.6 
 
 		 458 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  37.69 
 
 		 456 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 		 458 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  39.66 
 
 		 464 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  37.39 
 
 		 464 aa  286  5.999999999999999e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  38.21 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  38.65 
 
 		 473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  40.56 
 
 		 452 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  38.65 
 
 		 452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  36.98 
 
 		 475 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 456 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  39.11 
 
 		 448 aa  282  9e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  37.95 
 
 		 518 aa  281  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  34.89 
 
 		 469 aa  281  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  39.19 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  39.53 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  36.82 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1783  tRNA modification GTPase TrmE  38.6 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.028326  normal  0.377376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  40.49 
 
 		 448 aa  280  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  36.65 
 
 		 458 aa  279  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  37.86 
 
 		 455 aa  279  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  39.02 
 
 		 464 aa  279  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  36.46 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>