95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4083 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 
566 aa  1155    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  32.14 
 
 
544 aa  260  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  32.44 
 
 
543 aa  256  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  32.55 
 
 
554 aa  255  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  31.66 
 
 
555 aa  253  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  31.66 
 
 
555 aa  253  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  31.66 
 
 
555 aa  253  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  32.18 
 
 
552 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  32.18 
 
 
552 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  32.18 
 
 
552 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.18 
 
 
552 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  32.18 
 
 
552 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  32.18 
 
 
552 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  32.18 
 
 
552 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  32.18 
 
 
552 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  32.18 
 
 
552 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  30.27 
 
 
554 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  32.49 
 
 
553 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  30.94 
 
 
554 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.35 
 
 
552 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  30.92 
 
 
554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  31.65 
 
 
552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  30.7 
 
 
558 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  31.65 
 
 
552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  31.96 
 
 
552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  31.77 
 
 
544 aa  234  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  31.65 
 
 
552 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  31.6 
 
 
552 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  30.31 
 
 
553 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  27.98 
 
 
607 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.93 
 
 
640 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.91 
 
 
594 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.8 
 
 
647 aa  72.4  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  26.46 
 
 
695 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  22.92 
 
 
758 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  31.1 
 
 
594 aa  67  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  28.12 
 
 
613 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  24.48 
 
 
574 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  29.81 
 
 
598 aa  64.7  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  30.71 
 
 
682 aa  63.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  27.69 
 
 
564 aa  63.5  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  29.51 
 
 
596 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.23 
 
 
626 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  24.84 
 
 
703 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  29.52 
 
 
594 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  21.86 
 
 
650 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  24.73 
 
 
513 aa  54.3  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  30 
 
 
589 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  52.17 
 
 
604 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  22.65 
 
 
553 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.63 
 
 
607 aa  51.2  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.93 
 
 
712 aa  51.6  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  22.48 
 
 
688 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  28.8 
 
 
807 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  50 
 
 
598 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  25.61 
 
 
626 aa  50.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  29.46 
 
 
623 aa  50.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  21.53 
 
 
728 aa  50.4  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  26.37 
 
 
659 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.1 
 
 
634 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.35 
 
 
674 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  30.25 
 
 
661 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  50 
 
 
598 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  32.91 
 
 
159 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  22.44 
 
 
707 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  44.68 
 
 
641 aa  48.5  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  24.7 
 
 
349 aa  47.4  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  43.48 
 
 
586 aa  47.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  30 
 
 
877 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.75 
 
 
605 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.12 
 
 
616 aa  47  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  30 
 
 
877 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  30.53 
 
 
691 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  26.74 
 
 
628 aa  46.6  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  30 
 
 
877 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  31.87 
 
 
606 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.6 
 
 
637 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  24.84 
 
 
584 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.91 
 
 
564 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  42.86 
 
 
877 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  32.2 
 
 
600 aa  45.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  30.11 
 
 
610 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  40.74 
 
 
603 aa  44.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  29.41 
 
 
626 aa  44.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.57 
 
 
601 aa  44.3  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 
608 aa  44.3  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  25.26 
 
 
784 aa  44.3  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.73 
 
 
582 aa  44.3  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  21.88 
 
 
369 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  21.03 
 
 
714 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  23.83 
 
 
685 aa  44.3  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  42.86 
 
 
573 aa  44.3  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.68 
 
 
615 aa  43.9  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  31.58 
 
 
484 aa  43.9  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  24.18 
 
 
619 aa  43.5  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.924756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>