More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0693 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 351 aa  723    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  52.31 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  52.51 
 
 		 356 aa  352  4e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  50.15 
 
 		 352 aa  351  8.999999999999999e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  47.16 
 
 		 340 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  46.78 
 
 		 340 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  47.51 
 
 		 355 aa  328  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  46.2 
 
 		 340 aa  328  8e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  46.49 
 
 		 347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  45.03 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  46.13 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  46.04 
 
 		 345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  46.04 
 
 		 345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  45.61 
 
 		 339 aa  318  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  46.33 
 
 		 354 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  45.64 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  45.09 
 
 		 351 aa  310  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  44.84 
 
 		 365 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  45.66 
 
 		 351 aa  309  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 401 aa  308  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 371 aa  308  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  45.06 
 
 		 351 aa  305  5.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  44.08 
 
 		 343 aa  305  6e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  44.22 
 
 		 351 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  44.77 
 
 		 351 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  45.29 
 
 		 340 aa  301  9e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  44.8 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  43.24 
 
 		 348 aa  299  5e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  43.64 
 
 		 351 aa  299  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  42.52 
 
 		 345 aa  297  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  41.94 
 
 		 368 aa  293  3e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  42.9 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  41.91 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  42.23 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  43.7 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  42.06 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  41.42 
 
 		 345 aa  286  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  41.23 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  41.23 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  41.52 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  43.8 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  41.35 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  41.35 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  41.35 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  41.35 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  41.35 
 
 		 348 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  41.35 
 
 		 348 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  42.68 
 
 		 350 aa  278  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  41.35 
 
 		 348 aa  278  9e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  41.59 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  41.06 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  41.35 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 		 357 aa  276  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  40.24 
 
 		 340 aa  276  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  43.21 
 
 		 353 aa  275  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  41.12 
 
 		 369 aa  275  9e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  42.57 
 
 		 354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  42.57 
 
 		 354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  42.68 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  41.28 
 
 		 364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 350 aa  271  9e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  40.17 
 
 		 354 aa  269  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  41.24 
 
 		 357 aa  269  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  40.41 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  41.04 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  38.44 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  39.83 
 
 		 352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 353 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  39.54 
 
 		 354 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  40.12 
 
 		 357 aa  266  5e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  39.77 
 
 		 351 aa  265  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 		 365 aa  265  8.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  39.02 
 
 		 355 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  42.51 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  39.71 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  40.4 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  39.66 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0483  uroporphyrinogen decarboxylase  40.23 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 356 aa  262  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  41.18 
 
 		 353 aa  262  6e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  38.95 
 
 		 361 aa  262  8e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  38.95 
 
 		 402 aa  261  8.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  40.11 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  39.83 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  39.65 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  38.97 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  40 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  40.11 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0705  uroporphyrinogen decarboxylase  39.48 
 
 		 365 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  39.77 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  39.65 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>