More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3926 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  100 
 
 
715 aa  1412    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  79.68 
 
 
708 aa  998    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  41.79 
 
 
614 aa  365  2e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  40.18 
 
 
580 aa  319  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  41.96 
 
 
570 aa  313  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  37.19 
 
 
565 aa  309  9e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  34.79 
 
 
552 aa  297  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  37.1 
 
 
1652 aa  296  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  32.65 
 
 
899 aa  253  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  34.64 
 
 
569 aa  253  7e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  35.2 
 
 
560 aa  248  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  35.57 
 
 
579 aa  242  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  34.16 
 
 
552 aa  242  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  33.74 
 
 
598 aa  221  5e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  36.8 
 
 
665 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  32.61 
 
 
1217 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  30.66 
 
 
575 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  32.89 
 
 
627 aa  207  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  33.76 
 
 
535 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  32.73 
 
 
534 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  31.84 
 
 
657 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  33.67 
 
 
559 aa  200  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  33.09 
 
 
568 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  35.11 
 
 
674 aa  198  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 
621 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  30.37 
 
 
918 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  31.55 
 
 
610 aa  191  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  29.91 
 
 
526 aa  190  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  32.68 
 
 
532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  32.47 
 
 
580 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  32.24 
 
 
592 aa  183  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  32.62 
 
 
546 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  30.92 
 
 
533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  30.44 
 
 
1219 aa  155  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  30.32 
 
 
521 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  32.07 
 
 
1209 aa  151  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  32.67 
 
 
1224 aa  147  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  30.99 
 
 
1184 aa  146  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  27.3 
 
 
1219 aa  140  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  29.6 
 
 
1263 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  29.6 
 
 
1184 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  29.14 
 
 
1168 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  26.1 
 
 
700 aa  122  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  30.96 
 
 
541 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  27.75 
 
 
535 aa  115  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  29.88 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  30.17 
 
 
535 aa  108  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  26.38 
 
 
563 aa  108  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  25.89 
 
 
534 aa  100  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  26.99 
 
 
515 aa  99.8  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  24.78 
 
 
523 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  27.21 
 
 
526 aa  97.8  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 
515 aa  97.8  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  28.61 
 
 
522 aa  97.4  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  28.2 
 
 
513 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  28.2 
 
 
513 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  27.29 
 
 
521 aa  94.4  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  27.16 
 
 
543 aa  90.5  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  24.78 
 
 
521 aa  89  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  27.66 
 
 
613 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  26.69 
 
 
526 aa  87.4  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  27.46 
 
 
511 aa  87  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  22.44 
 
 
549 aa  87  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  27.9 
 
 
513 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  25.83 
 
 
521 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  25.47 
 
 
530 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  25.18 
 
 
544 aa  85.5  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  26.28 
 
 
522 aa  85.1  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  25.29 
 
 
517 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  26.46 
 
 
518 aa  84.7  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  26.28 
 
 
511 aa  84  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  23.52 
 
 
521 aa  84  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  26.41 
 
 
529 aa  83.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  28.01 
 
 
648 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  28.73 
 
 
512 aa  82  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0037  putative virulence factor MviN-like protein  28.57 
 
 
518 aa  81.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236522  normal  0.272739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  27.39 
 
 
515 aa  82  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  27.35 
 
 
545 aa  81.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  27.32 
 
 
539 aa  80.9  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  25.58 
 
 
522 aa  80.9  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  30.73 
 
 
538 aa  80.9  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  24.24 
 
 
539 aa  80.9  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  25 
 
 
530 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1917  virulence factor MVIN family protein  28.84 
 
 
568 aa  79.7  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.731846  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  23.42 
 
 
534 aa  79.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  23.99 
 
 
521 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  25.77 
 
 
511 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  25.77 
 
 
511 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  25.77 
 
 
511 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  25.77 
 
 
511 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  26.6 
 
 
529 aa  77.8  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  26.41 
 
 
555 aa  77.8  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  26.88 
 
 
531 aa  77.4  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  25.65 
 
 
524 aa  77.4  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  25.53 
 
 
511 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  26.68 
 
 
511 aa  77.4  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  25.53 
 
 
511 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  25.53 
 
 
511 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  25.53 
 
 
511 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  25.53 
 
 
511 aa  77.4  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>