More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3839 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 247 aa  487  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  76.52 
 
 		 257 aa  354  7.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  45.75 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 		 276 aa  158  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 270 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  38.27 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  40.32 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  36.55 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  36.48 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  31.51 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  33.78 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  33.06 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 238 aa  98.6  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  32.91 
 
 		 234 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  32.91 
 
 		 234 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  32.91 
 
 		 234 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  30.74 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  31.28 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  39.58 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  30.8 
 
 		 267 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.74 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  29.15 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  33.02 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  32.28 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  34.01 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 283 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  25 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  27.75 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  20.9 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  31.65 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  26.89 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  27.63 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  21.78 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  27.19 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  27.19 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  23.93 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  26.91 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  29.78 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  28.89 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  22.37 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  31.71 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  29.22 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  25.81 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  24.59 
 
 		 259 aa  72  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 324 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  22.71 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  27.35 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  22.22 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>