122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1235 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  100 
 
 
319 aa  646    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  74.32 
 
 
323 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  50 
 
 
323 aa  296  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  42.14 
 
 
318 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  44.64 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  43.33 
 
 
307 aa  212  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  39 
 
 
303 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  39.12 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  37.54 
 
 
308 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  37.62 
 
 
315 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  38.38 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  37.71 
 
 
302 aa  168  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  37.25 
 
 
307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  38.1 
 
 
294 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  39.26 
 
 
297 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  34.64 
 
 
327 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  35.57 
 
 
299 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  39.92 
 
 
301 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  36.36 
 
 
303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  34.68 
 
 
308 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
300 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  36.39 
 
 
305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  34.98 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  32.31 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  34.13 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  32.69 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  32.65 
 
 
299 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  31.82 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  34.24 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  32.32 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  32.32 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  32.32 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  31.29 
 
 
300 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  32.77 
 
 
299 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  36.42 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  34.36 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  34.68 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  29.49 
 
 
295 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  29.49 
 
 
295 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  29.49 
 
 
295 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  30.95 
 
 
311 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  28.09 
 
 
312 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  29.11 
 
 
280 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  28.77 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  28.52 
 
 
316 aa  89.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  33.05 
 
 
328 aa  87  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  26.79 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  26.21 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  28.97 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  30.08 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  26.15 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  28.24 
 
 
263 aa  68.9  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  27.2 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  27 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  27.49 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  28.9 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  25.49 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  25.49 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  30.97 
 
 
361 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  30.41 
 
 
376 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  25.59 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  29.02 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  24.19 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  30.32 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  25.94 
 
 
299 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  27.88 
 
 
282 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  29.82 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  24.81 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3474  Aldose 1-epimerase  27.18 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.84486 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  29.95 
 
 
360 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  29.95 
 
 
360 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  26.21 
 
 
276 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1047  hypothetical protein  26.17 
 
 
293 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3762  Aldose 1-epimerase  27.91 
 
 
296 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.993298  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  25.66 
 
 
327 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  23.53 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  28.16 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  26.55 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  22.66 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  29.36 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  31.23 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  25 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  25.09 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  23.9 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  27.66 
 
 
346 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  28.16 
 
 
300 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  28.16 
 
 
300 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  28.44 
 
 
362 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  24.1 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  27.35 
 
 
300 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  27.83 
 
 
294 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  25.42 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  25.3 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  26.9 
 
 
359 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  28.9 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  28.9 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  29.46 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  30.49 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  30.28 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  28.5 
 
 
294 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>