177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0111 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 190 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  44.21 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  41.15 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  41.08 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  40 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  43.32 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  41.27 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  33.48 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  36.32 
 
 		 180 aa  91.7  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7219  2'-5' RNA ligase  43.31 
 
 		 224 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  39.19 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  37.1 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  33.19 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  30.65 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  38.65 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  38.04 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  32.66 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  32.11 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5825  2'-5' RNA ligase  36.05 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  37.76 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  36.23 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  26.47 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  36.42 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17160  2'-5' RNA ligase  33.49 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0177806  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  30.37 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14670  2'-5' RNA ligase  34.39 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.346276  normal  0.71286 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  30.32 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  35.66 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  37.8 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  32.34 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  30.26 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  34.5 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  35.03 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  32.39 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  40.19 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  39.13 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  30.05 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  34.68 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  28.06 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  39.75 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  39.13 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  34.51 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  37.91 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  31.65 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  34.39 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  25.4 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  30.06 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  32.85 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  25.74 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0508  2'-5' RNA ligase  34.34 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170013  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  28.64 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  31.9 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  29.95 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  28.64 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  32.04 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  31.22 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1029  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  32.45 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  31.25 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  22.63 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  35.26 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  35.25 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  32.11 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  27.33 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  37.78 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  25.49 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  25.15 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  32.61 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  30.41 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  34.39 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  31.21 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  32.11 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  21.93 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  38 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0088  2',5' RNA ligase  36.17 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  30.57 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  33.58 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  33.72 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1320  2'-5' RNA ligase  28.86 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  28.99 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  32.11 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  32.64 
 
 		 154 aa  52  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  20.83 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  26.43 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  29.75 
 
 		 192 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  25.35 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  20.73 
 
 		 173 aa  51.2  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  22.87 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  38.6 
 
 		 298 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  29.19 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  29.73 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  26.24 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  30.28 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  28.66 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  26.24 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  24.74 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  22.68 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  23.23 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>