83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1334 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  100 
 
 		 1025 aa  2021    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  28.75 
 
 		 972 aa  123  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  37.55 
 
 		 365 aa  118  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  29.72 
 
 		 1628 aa  87.4  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  29.5 
 
 		 804 aa  87  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  28.25 
 
 		 1242 aa  79.3  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  27.81 
 
 		 400 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  27.99 
 
 		 1332 aa  72.8  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  26.46 
 
 		 595 aa  71.2  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  29.53 
 
 		 831 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  27.41 
 
 		 1200 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  29.69 
 
 		 641 aa  68.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  23.77 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  23.55 
 
 		 400 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.14 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.14 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  28.52 
 
 		 441 aa  63.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0688  Fibronectin type III domain protein  32.03 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.53 
 
 		 677 aa  62.4  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  22.36 
 
 		 1931 aa  62.4  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  29.95 
 
 		 820 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  30.43 
 
 		 892 aa  60.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  29.8 
 
 		 570 aa  59.7  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  28.12 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  23.17 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.72 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  34.56 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  25.48 
 
 		 638 aa  57.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  22.92 
 
 		 459 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.27 
 
 		 459 aa  55.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  26.64 
 
 		 483 aa  55.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  23.33 
 
 		 454 aa  55.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  24.73 
 
 		 423 aa  55.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  23.13 
 
 		 425 aa  53.9  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  24.73 
 
 		 431 aa  53.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  24.73 
 
 		 431 aa  53.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  25.79 
 
 		 462 aa  52.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  30.23 
 
 		 805 aa  52.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  26.37 
 
 		 422 aa  52.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  23.61 
 
 		 437 aa  52  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  27.52 
 
 		 409 aa  51.6  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  25.61 
 
 		 452 aa  51.6  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  21.77 
 
 		 439 aa  51.2  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0795  hypothetical protein  26.57 
 
 		 456 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.06 
 
 		 458 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.53 
 
 		 458 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0908  hypothetical protein  27.31 
 
 		 449 aa  51.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0731349  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.79 
 
 		 464 aa  51.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 1121 aa  50.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.79 
 
 		 464 aa  51.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  28.4 
 
 		 5453 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1699  hypothetical protein  23.85 
 
 		 489 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.72795 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  27.52 
 
 		 454 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  24.77 
 
 		 417 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.48 
 
 		 467 aa  49.3  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  27.85 
 
 		 503 aa  48.9  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  23.24 
 
 		 400 aa  48.9  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.95 
 
 		 510 aa  48.9  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 		 674 aa  48.5  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  32.53 
 
 		 341 aa  48.1  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  25.6 
 
 		 452 aa  48.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.58 
 
 		 685 aa  47.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  27.84 
 
 		 352 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  23.08 
 
 		 429 aa  47.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  32.14 
 
 		 777 aa  46.6  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  27.59 
 
 		 1056 aa  47  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.76 
 
 		 425 aa  47  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  25.46 
 
 		 446 aa  47  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  37.93 
 
 		 735 aa  46.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  27.06 
 
 		 720 aa  46.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  32.35 
 
 		 457 aa  45.8  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  23.35 
 
 		 446 aa  45.8  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  23.56 
 
 		 423 aa  45.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  23.4 
 
 		 443 aa  45.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  23.56 
 
 		 423 aa  45.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.96 
 
 		 594 aa  45.4  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0456  Parallel beta-helix repeat protein  28.08 
 
 		 2615 aa  45.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  27.47 
 
 		 424 aa  45.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  30.35 
 
 		 940 aa  45.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.79 
 
 		 447 aa  45.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.11 
 
 		 230 aa  45.1  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.24 
 
 		 614 aa  44.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  25.77 
 
 		 863 aa  44.7  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>