96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0183 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  100 
 
 		 436 aa  854    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  32.51 
 
 		 327 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  30.56 
 
 		 349 aa  99.8  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  26.71 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  26.81 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  31.82 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  29.43 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  28.94 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  33.54 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  29.66 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  32.92 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  28.38 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  26.27 
 
 		 576 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.7 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  38.21 
 
 		 292 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  31.01 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  34.23 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  34.34 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  31.75 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  35.4 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  27.14 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  29.74 
 
 		 508 aa  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.55 
 
 		 422 aa  63.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  29.79 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  32.54 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0762  Beta-lactamase  27.92 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0608621  hitchhiker  0.000417556 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  25 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  29.5 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.59 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  34.48 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  27.27 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3136  Beta-lactamase  38.61 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570574  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  28.65 
 
 		 423 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  26.58 
 
 		 297 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  32.02 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  28.14 
 
 		 259 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  31.03 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  28.14 
 
 		 259 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03900  beta-lactamase class A  32.77 
 
 		 273 aa  53.9  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  31.25 
 
 		 283 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4009  Beta-lactamase  32.77 
 
 		 315 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  33.86 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  34.92 
 
 		 296 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  28.22 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  31.54 
 
 		 296 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  30.43 
 
 		 286 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  26.28 
 
 		 312 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  31.54 
 
 		 296 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  32.77 
 
 		 304 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  30.6 
 
 		 296 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  31.54 
 
 		 296 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  28.26 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  25.9 
 
 		 300 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  34.57 
 
 		 293 aa  50.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1164  Beta-lactamase  31.9 
 
 		 300 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  33.05 
 
 		 288 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  32.73 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3438  Beta-lactamase  32.71 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000252783  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  34.78 
 
 		 299 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  32.71 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  26.76 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  33.33 
 
 		 296 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  24.39 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  26.47 
 
 		 803 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  33.33 
 
 		 296 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  30.17 
 
 		 296 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  25.49 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4877  Beta-lactamase  32.31 
 
 		 297 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00066031  hitchhiker  0.000000000265752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  31.69 
 
 		 320 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  40.24 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  28.26 
 
 		 292 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1856  Beta-lactamase class A  30.43 
 
 		 243 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000412045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2257  hypothetical protein  28.8 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1435  Beta-lactamase  25.69 
 
 		 288 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  27.36 
 
 		 304 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  27.95 
 
 		 296 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4360  Beta-lactamase  31.54 
 
 		 297 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000108699  unclonable  0.00000562292 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  36.46 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5706  Beta-lactamase  32.71 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  34.82 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  33.58 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1324  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.65 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  27.82 
 
 		 357 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  38.96 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  26.72 
 
 		 297 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  35.14 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  29.63 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3231  Beta-lactamase  28.99 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  35.23 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  29.66 
 
 		 305 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  30.39 
 
 		 271 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0088  Beta-lactamase  32.76 
 
 		 291 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  24.63 
 
 		 288 aa  43.5  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  30.7 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  30.63 
 
 		 296 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3689  Beta-lactamase  33.8 
 
 		 302 aa  43.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248785  normal  0.574937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>