15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1856 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1856  Beta-lactamase class A  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000412045 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1769  Beta-lactamase class A  29.26 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000508947 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1067  Beta-lactamase class A  32.26 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.771599  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  26.13 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  29.41 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  29.41 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  32.41 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  29.63 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  24.51 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  30.43 
 
 		 436 aa  48.5  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  24.77 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  21.88 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6760  Beta-lactamase class A-like protein  41.51 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  26.17 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  24.49 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>