13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1067 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1067  Beta-lactamase class A  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.771599  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1856  Beta-lactamase class A  32.26 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000412045 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  28.4 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  26.86 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1769  Beta-lactamase class A  25.33 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000508947 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  27.54 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  27.54 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  24.43 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  24.19 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  25.1 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  35.11 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  24.52 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  45.45 
 
 		 283 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>