240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2635 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2635  iron chelate ABC transporter periplasmic iron/siderophore-binding protein  100 
 
 
363 aa  744  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.97529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2720  periplasmic binding protein  99.45 
 
 
363 aa  742  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  2.54593e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  41.83 
 
 
429 aa  313  3e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  37.64 
 
 
368 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  37.75 
 
 
407 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  39.11 
 
 
365 aa  254  2e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2718  periplasmic binding protein  34.55 
 
 
360 aa  246  5e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410203  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  36.13 
 
 
364 aa  243  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  27.42 
 
 
384 aa  185  1e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  28.82 
 
 
427 aa  179  5e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  6.09348e-05 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  28.09 
 
 
392 aa  170  4e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  27.95 
 
 
373 aa  141  2e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  26.32 
 
 
375 aa  139  8e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  26.04 
 
 
377 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  26.04 
 
 
375 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3141  periplasmic binding protein  27.96 
 
 
371 aa  135  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3089  periplasmic binding protein  27.94 
 
 
375 aa  134  2e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  28.29 
 
 
373 aa  134  2e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.79 
 
 
381 aa  129  7e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  27.79 
 
 
389 aa  129  9e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.79 
 
 
389 aa  129  9e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  24.34 
 
 
406 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  27.98 
 
 
377 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1693  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  25.9 
 
 
370 aa  119  1e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2249  periplasmic binding protein  24.26 
 
 
378 aa  117  4e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.254495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1220  ABC transporter substrate binding protein (iron)  25.14 
 
 
383 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0816  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.63 
 
 
366 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0154  hypothetical protein  26.63 
 
 
366 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  6.56293e-06 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0816  periplasmic binding protein  26.63 
 
 
366 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0919646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1100  ABC transporter, substrate binding protein  28.1 
 
 
374 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0595516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  29.83 
 
 
368 aa  114  4e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  24.62 
 
 
394 aa  112  7e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2755  ABC transporter, substrate binding protein  25.32 
 
 
375 aa  111  2e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  1.38231e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1015  periplasmic binding protein  25.69 
 
 
371 aa  111  2e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.543354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  24.49 
 
 
378 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  25.66 
 
 
365 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  25.81 
 
 
370 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3900  periplasmic binding protein  23.9 
 
 
386 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4077  periplasmic binding protein  24.23 
 
 
383 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1240  periplasmic binding protein  25.21 
 
 
372 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3035  periplasmic binding protein  24.46 
 
 
372 aa  106  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2194  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  25.35 
 
 
377 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.0100465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  28.15 
 
 
369 aa  102  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0797  periplasmic binding protein  28.45 
 
 
367 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0161104  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  24.49 
 
 
383 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0573  ABC transporter, substrate binding protein  24.93 
 
 
374 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.470776  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  26.24 
 
 
517 aa  96.3  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  26.21 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3531  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  26.9 
 
 
382 aa  93.2  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826718  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4137  ferrichrome/ferrioxamine B periplasmic transporter  21.37 
 
 
365 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  25.7 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  23.78 
 
 
483 aa  83.2  6e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  24.51 
 
 
478 aa  81.6  2e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  6.73824e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
689 aa  78.2  2e-13  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  26.03 
 
 
380 aa  75.9  1e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  24.63 
 
 
362 aa  74.3  3e-12  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  2.78634e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  27.62 
 
 
688 aa  73.9  4e-12  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  26.25 
 
 
377 aa  73.2  6e-12  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  24.51 
 
 
409 aa  72.8  9e-12  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.79 
 
 
375 aa  70.5  5e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  24.29 
 
 
401 aa  68.9  1e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  26.44 
 
 
409 aa  68.6  2e-10  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1774  periplasmic binding protein  20.92 
 
 
363 aa  67  5e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  23.04 
 
 
366 aa  66.2  9e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  22.06 
 
 
390 aa  65.1  2e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  24.79 
 
 
396 aa  64.3  3e-09  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  23.88 
 
 
402 aa  63.2  7e-09  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  23.31 
 
 
356 aa  62.8  8e-09  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  25.28 
 
 
393 aa  62.8  9e-09  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
307 aa  62.4  1e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  24.93 
 
 
429 aa  61.6  2e-08  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  25.69 
 
 
300 aa  60.5  5e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  23.84 
 
 
341 aa  60.1  7e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  25 
 
 
339 aa  59.3  9e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  25.29 
 
 
361 aa  59.3  9e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  27.9 
 
 
372 aa  59.3  1e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  23.74 
 
 
381 aa  59.3  1e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.12893e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  22.22 
 
 
380 aa  59.3  1e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  23.5 
 
 
373 aa  59.3  1e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  21.8 
 
 
313 aa  58.2  2e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  1.01276e-10 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3099  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.7 
 
 
276 aa  58.2  2e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  23.6 
 
 
361 aa  58.2  2e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  22.02 
 
 
338 aa  57.8  3e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  27.59 
 
 
358 aa  57.8  3e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  22.08 
 
 
362 aa  57  4e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  23.97 
 
 
375 aa  57  5e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  21.9 
 
 
318 aa  56.6  6e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  25.83 
 
 
374 aa  56.6  7e-07  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  23.17 
 
 
374 aa  56.2  8e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  23.49 
 
 
379 aa  55.5  1e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  20.55 
 
 
375 aa  55.5  1e-06  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  19.1 
 
 
305 aa  55.5  1e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  25.51 
 
 
300 aa  55.5  1e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  25.52 
 
 
390 aa  55.8  1e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  21.82 
 
 
426 aa  55.5  1e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  6.29133e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  22.04 
 
 
345 aa  55.5  2e-06  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  18.28 
 
 
372 aa  55.1  2e-06  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  20.2 
 
 
375 aa  55.1  2e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  22.87 
 
 
376 aa  54.7  2e-06  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  24.91 
 
 
310 aa  54.7  3e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>