More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3357 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
825 aa  1665    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  56.39 
 
 
808 aa  817    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  45.81 
 
 
836 aa  584  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  41.72 
 
 
890 aa  525  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.61 
 
 
764 aa  507  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  40.08 
 
 
803 aa  479  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  41.04 
 
 
859 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  39.47 
 
 
727 aa  421  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  39.81 
 
 
764 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  35.69 
 
 
774 aa  374  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
695 aa  375  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
778 aa  364  4e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  37.01 
 
 
719 aa  352  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  36.92 
 
 
724 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 
1245 aa  332  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  33.64 
 
 
822 aa  326  9e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.79 
 
 
747 aa  323  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 
1065 aa  322  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  36.69 
 
 
1306 aa  320  6e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 
725 aa  319  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.38 
 
 
1129 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  33.53 
 
 
752 aa  313  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
806 aa  312  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
806 aa  312  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
806 aa  312  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  34.14 
 
 
1117 aa  310  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  36.29 
 
 
821 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 
815 aa  292  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  32.5 
 
 
961 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  33.33 
 
 
784 aa  286  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  31.47 
 
 
739 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  34.46 
 
 
761 aa  283  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  35.48 
 
 
710 aa  282  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  33.51 
 
 
734 aa  281  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.7 
 
 
814 aa  280  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
975 aa  278  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  33.73 
 
 
807 aa  277  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 
867 aa  277  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.74 
 
 
776 aa  277  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.73 
 
 
648 aa  275  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  31.66 
 
 
735 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  32.25 
 
 
720 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
830 aa  274  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  31.99 
 
 
770 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  33.38 
 
 
714 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.79 
 
 
643 aa  270  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  32.07 
 
 
732 aa  270  8.999999999999999e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.79 
 
 
643 aa  270  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  32.54 
 
 
732 aa  269  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  32.5 
 
 
728 aa  269  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  31.39 
 
 
643 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  32.97 
 
 
741 aa  268  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  32.2 
 
 
734 aa  267  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  31.13 
 
 
648 aa  266  8.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.01 
 
 
950 aa  266  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  33.5 
 
 
704 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
979 aa  265  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  34.25 
 
 
714 aa  265  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  31.91 
 
 
727 aa  265  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 
712 aa  264  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  30.85 
 
 
727 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  32.31 
 
 
640 aa  263  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
769 aa  263  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  30.55 
 
 
811 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  34.73 
 
 
750 aa  262  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  29.66 
 
 
824 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  32.07 
 
 
755 aa  262  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.5 
 
 
661 aa  262  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  29.66 
 
 
824 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  31.21 
 
 
683 aa  261  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  32.69 
 
 
730 aa  261  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  32.54 
 
 
763 aa  261  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  33.33 
 
 
765 aa  261  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  29.53 
 
 
720 aa  260  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.18 
 
 
618 aa  260  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  32.2 
 
 
723 aa  260  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  33.39 
 
 
765 aa  260  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  33.98 
 
 
750 aa  259  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  30.61 
 
 
683 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  31.3 
 
 
833 aa  259  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  30.61 
 
 
683 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  31.54 
 
 
776 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  33.28 
 
 
775 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  32.24 
 
 
978 aa  258  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  32.37 
 
 
712 aa  258  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  32.17 
 
 
779 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  32.25 
 
 
640 aa  257  8e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  30.45 
 
 
683 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  30.45 
 
 
683 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  31.53 
 
 
751 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  31.32 
 
 
833 aa  255  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  30.38 
 
 
683 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  30.26 
 
 
683 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  30.38 
 
 
683 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  31.49 
 
 
626 aa  254  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  30.13 
 
 
683 aa  253  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  31.18 
 
 
676 aa  253  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  31.38 
 
 
728 aa  253  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  32.08 
 
 
723 aa  251  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  31.69 
 
 
817 aa  251  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>