168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2244 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  100 
 
 		 534 aa  1084    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1540  nuclease  39.02 
 
 		 355 aa  202  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6821  OmpA/MotB domain protein  38.25 
 
 		 324 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.438256  normal  0.396252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  53.55 
 
 		 166 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  50 
 
 		 212 aa  135  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  45.65 
 
 		 211 aa  130  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  45.83 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  47.89 
 
 		 172 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  45.83 
 
 		 227 aa  127  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  45.14 
 
 		 227 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  45.14 
 
 		 227 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  44.14 
 
 		 158 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  41.77 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  50.98 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  44.85 
 
 		 176 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  43.38 
 
 		 241 aa  107  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  41.79 
 
 		 242 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  41.5 
 
 		 221 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  41.26 
 
 		 241 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  41.61 
 
 		 208 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  40.74 
 
 		 167 aa  100  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  35.86 
 
 		 184 aa  99  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  40.15 
 
 		 358 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  39.13 
 
 		 242 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  41.79 
 
 		 243 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  36.84 
 
 		 189 aa  95.9  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1850  hypothetical protein  35.33 
 
 		 215 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.863369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  36.84 
 
 		 189 aa  95.9  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  43.94 
 
 		 214 aa  94.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  41.35 
 
 		 211 aa  92  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  42.42 
 
 		 226 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  40.28 
 
 		 214 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  40.98 
 
 		 185 aa  90.5  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  41.35 
 
 		 209 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  36.36 
 
 		 177 aa  87  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  40.14 
 
 		 226 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  35.07 
 
 		 177 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  35.07 
 
 		 177 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  37.75 
 
 		 195 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  39.86 
 
 		 192 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  38.06 
 
 		 202 aa  82  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2738  hypothetical protein  36.42 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.374977  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1869  hypothetical protein  33.75 
 
 		 253 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35939  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4290  hypothetical protein  34.76 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  35.46 
 
 		 148 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  32.61 
 
 		 220 aa  75.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  39.13 
 
 		 163 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  37.23 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  36.5 
 
 		 175 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  37.23 
 
 		 175 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  36.5 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  39.1 
 
 		 192 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  34.16 
 
 		 171 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  36.36 
 
 		 249 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  38.14 
 
 		 136 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  38.62 
 
 		 175 aa  69.7  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  39.45 
 
 		 169 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  35.15 
 
 		 179 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  31.69 
 
 		 166 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  38.52 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  36.67 
 
 		 158 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  33.99 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1705  hypothetical protein  28.11 
 
 		 263 aa  67  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  32.3 
 
 		 156 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  31.25 
 
 		 199 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  35.37 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  34.01 
 
 		 153 aa  62  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  29.81 
 
 		 164 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  35.29 
 
 		 168 aa  60.1  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  32.21 
 
 		 155 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  30.46 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  33.1 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  31.94 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  31.65 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  32.12 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3714  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  40.62 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  32.03 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  31.06 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4182  succinoglycan biosynthesis protein exoI-like  34.65 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  31.91 
 
 		 180 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  32.45 
 
 		 170 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  36.03 
 
 		 161 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  35.88 
 
 		 250 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  34.71 
 
 		 175 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  33.58 
 
 		 246 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  26.92 
 
 		 233 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  31.03 
 
 		 286 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  33.55 
 
 		 194 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  35.92 
 
 		 169 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  36.73 
 
 		 122 aa  54.7  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  31.03 
 
 		 187 aa  54.3  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  34.78 
 
 		 238 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 221 aa  53.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 171 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  25.64 
 
 		 227 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  34.29 
 
 		 157 aa  52.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  31.41 
 
 		 221 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6410  succinoglycan biosynthesis protein ExoI-like protein  30.77 
 
 		 178 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  31.58 
 
 		 258 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>