More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3480 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  40.67 
 
 		 3033 aa  857    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  40.96 
 
 		 3463 aa  1546    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.87 
 
 		 1867 aa  773    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  44.33 
 
 		 1071 aa  651    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  38.67 
 
 		 3508 aa  1403    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  37.02 
 
 		 2719 aa  812    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  35.83 
 
 		 2066 aa  798    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  38.02 
 
 		 1584 aa  767    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  39.86 
 
 		 4930 aa  798    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  48.46 
 
 		 3449 aa  740    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  42.14 
 
 		 2024 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  45.16 
 
 		 2367 aa  646    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.26 
 
 		 1126 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  44.36 
 
 		 5154 aa  1731    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 		 3092 aa  922    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  38.88 
 
 		 4111 aa  730    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  44.62 
 
 		 1602 aa  660    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  36.37 
 
 		 3176 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 		 1837 aa  735    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  42.21 
 
 		 3158 aa  795    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  48.32 
 
 		 4840 aa  1134    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  41.52 
 
 		 7279 aa  2128    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  40.77 
 
 		 2081 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  47.35 
 
 		 1601 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  44.74 
 
 		 1831 aa  716    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  41.94 
 
 		 2107 aa  894    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  38.8 
 
 		 2846 aa  1371    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 		 7110 aa  1817    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.63 
 
 		 3693 aa  699    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  45.56 
 
 		 2966 aa  1449    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  44.84 
 
 		 3148 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  41.47 
 
 		 3930 aa  848    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  39.27 
 
 		 1955 aa  884    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  39.12 
 
 		 2108 aa  739    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  37.31 
 
 		 2847 aa  964    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  37.72 
 
 		 1573 aa  698    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  42.64 
 
 		 3494 aa  1605    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 1816 aa  872    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  42.77 
 
 		 2374 aa  682    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  41.11 
 
 		 4080 aa  1786    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  47.81 
 
 		 1143 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  42.02 
 
 		 3408 aa  1540    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  36.75 
 
 		 4478 aa  707    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  49.35 
 
 		 1593 aa  695    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  44.08 
 
 		 3281 aa  878    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.63 
 
 		 3693 aa  699    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  36.98 
 
 		 4183 aa  665    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  40.04 
 
 		 2113 aa  862    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  46.61 
 
 		 2090 aa  752    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 3874 aa  969    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  44.44 
 
 		 2666 aa  983    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.2 
 
 		 1101 aa  751    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.4 
 
 		 3676 aa  702    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  37.8 
 
 		 4882 aa  917    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.6 
 
 		 3696 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  44.56 
 
 		 3355 aa  1384    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.62 
 
 		 1305 aa  676    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  100 
 
 		 4264 aa  8353    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.05 
 
 		 5400 aa  1605    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  35.51 
 
 		 2880 aa  808    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  40.71 
 
 		 3711 aa  1546    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  40.82 
 
 		 1548 aa  906    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  44.91 
 
 		 4151 aa  957    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  38.17 
 
 		 2277 aa  1097    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.91 
 
 		 3702 aa  703    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  45.14 
 
 		 3670 aa  874    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  44.7 
 
 		 6768 aa  885    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  44.44 
 
 		 4575 aa  850    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  45.72 
 
 		 1789 aa  734    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  43.3 
 
 		 5255 aa  1668    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  44.71 
 
 		 3254 aa  906    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  45.3 
 
 		 4607 aa  712    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.55 
 
 		 2762 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  36.87 
 
 		 3679 aa  677    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  46.54 
 
 		 1820 aa  683    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  42.93 
 
 		 3493 aa  776    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.96 
 
 		 3645 aa  674    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  45.21 
 
 		 2020 aa  729    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  47.07 
 
 		 1114 aa  743    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  37.23 
 
 		 3400 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  43.25 
 
 		 7210 aa  1799    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 		 2551 aa  634  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  43.4 
 
 		 1924 aa  634  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  35.67 
 
 		 3427 aa  613  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  45.03 
 
 		 1077 aa  609  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  41.04 
 
 		 2126 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  39.66 
 
 		 2890 aa  608  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  32.69 
 
 		 4165 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  42.57 
 
 		 2376 aa  603  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  39.11 
 
 		 1144 aa  602  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  36.03 
 
 		 2232 aa  597  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  40.97 
 
 		 2230 aa  592  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  44.53 
 
 		 2060 aa  594  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.18 
 
 		 2078 aa  589  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.47 
 
 		 2136 aa  585  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  35.7 
 
 		 1559 aa  582  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 1874 aa  579  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.51 
 
 		 1656 aa  581  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.97 
 
 		 1559 aa  579  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  34.98 
 
 		 1939 aa  572  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>