More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2274 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2274  putative secretory protein  100 
 
 		 446 aa  890    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414077  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  63.04 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  53.48 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  49.13 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  46.86 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  46.76 
 
 		 445 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  51.17 
 
 		 472 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  45.23 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  52.75 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  57.14 
 
 		 412 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  46.63 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  45.35 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  47.61 
 
 		 479 aa  372  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  47.25 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  48.09 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  45.43 
 
 		 467 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  46.9 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  45.77 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  47.1 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  49.47 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  49.22 
 
 		 491 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  52.63 
 
 		 470 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  45.73 
 
 		 442 aa  362  6e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  47.77 
 
 		 437 aa  362  9e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  46.29 
 
 		 463 aa  362  9e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  44.47 
 
 		 460 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  51.32 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  47.52 
 
 		 437 aa  361  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  45.14 
 
 		 453 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  50.27 
 
 		 474 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  52.1 
 
 		 471 aa  361  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  45.08 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  46.55 
 
 		 465 aa  360  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  48.22 
 
 		 468 aa  360  3e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  46.37 
 
 		 455 aa  360  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  48.28 
 
 		 452 aa  359  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  47.75 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  45.86 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1833  type II secretion system protein E  48.14 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  44.96 
 
 		 454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  47.03 
 
 		 624 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  45.86 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  45.86 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  49.08 
 
 		 457 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  47.09 
 
 		 677 aa  356  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  47.69 
 
 		 487 aa  355  6.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  45.36 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  43.17 
 
 		 589 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  47.61 
 
 		 488 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  44.78 
 
 		 454 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  43.6 
 
 		 481 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  54.08 
 
 		 491 aa  352  7e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  44.42 
 
 		 569 aa  352  8e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  44.55 
 
 		 455 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  46.02 
 
 		 454 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  46.02 
 
 		 454 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  46.02 
 
 		 454 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  44.31 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  47.66 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  43.96 
 
 		 572 aa  350  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  44.61 
 
 		 456 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  47.4 
 
 		 484 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  47.66 
 
 		 485 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  49.03 
 
 		 594 aa  349  5e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  47.48 
 
 		 500 aa  349  5e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  45.18 
 
 		 466 aa  349  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  44.7 
 
 		 467 aa  349  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1126  type II secretion system protein E  46.04 
 
 		 484 aa  348  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  47.87 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  46.3 
 
 		 478 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  47.26 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  47.27 
 
 		 467 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  47.87 
 
 		 482 aa  347  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  46.63 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  45.66 
 
 		 496 aa  348  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  52.28 
 
 		 411 aa  348  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  47.15 
 
 		 477 aa  348  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  44.39 
 
 		 639 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  45.59 
 
 		 482 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  45.69 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  49.03 
 
 		 498 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  49.57 
 
 		 477 aa  346  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  46.01 
 
 		 491 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  45.52 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  51.15 
 
 		 560 aa  345  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  49.57 
 
 		 476 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  46.54 
 
 		 492 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  49.57 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  44.36 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  49.51 
 
 		 495 aa  344  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  45.71 
 
 		 482 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  47.07 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  49.86 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  47.52 
 
 		 478 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  49.28 
 
 		 488 aa  343  4e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  49.57 
 
 		 490 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  49.28 
 
 		 482 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  46.01 
 
 		 491 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  43.87 
 
 		 504 aa  343  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  48.46 
 
 		 465 aa  343  5e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>