More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1126 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1126  type II secretion system protein E  100 
 
 		 484 aa  993    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  76.65 
 
 		 485 aa  692    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  75.15 
 
 		 484 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  76.67 
 
 		 496 aa  731    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  75.36 
 
 		 485 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  74.9 
 
 		 485 aa  682    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  53.08 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  55.9 
 
 		 459 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  52.45 
 
 		 462 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  55.18 
 
 		 456 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  54 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  52.59 
 
 		 460 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  50.77 
 
 		 452 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  51.43 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  54.11 
 
 		 481 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  52.73 
 
 		 455 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  52.97 
 
 		 455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  54.44 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  50.79 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  52.73 
 
 		 455 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  50.79 
 
 		 455 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  53 
 
 		 457 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  50.78 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  52.73 
 
 		 455 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  53.25 
 
 		 454 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  55.72 
 
 		 416 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  52.04 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  53.25 
 
 		 454 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  49.78 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  53.25 
 
 		 454 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  52.64 
 
 		 455 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  52.04 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  52.71 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  49.24 
 
 		 463 aa  458  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  54.33 
 
 		 624 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  51.08 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  48.72 
 
 		 451 aa  458  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  53.06 
 
 		 479 aa  457  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  48.16 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  53.35 
 
 		 444 aa  458  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  52.64 
 
 		 442 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  52.43 
 
 		 441 aa  455  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  53.24 
 
 		 452 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  50.36 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  52.63 
 
 		 468 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  53.49 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  52.4 
 
 		 452 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  51.94 
 
 		 473 aa  443  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  46.64 
 
 		 487 aa  442  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  49.21 
 
 		 489 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  50.81 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  46.96 
 
 		 467 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  47 
 
 		 488 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  48.45 
 
 		 572 aa  435  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  50.31 
 
 		 560 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  52.04 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  49.32 
 
 		 437 aa  435  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  51.07 
 
 		 490 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  45.89 
 
 		 477 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  49.01 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  50.97 
 
 		 488 aa  433  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  46.7 
 
 		 478 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  50.7 
 
 		 457 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  52.17 
 
 		 433 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  48.56 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  49.31 
 
 		 485 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  49.22 
 
 		 467 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  51.58 
 
 		 521 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  50.35 
 
 		 483 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  48.86 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  50.35 
 
 		 482 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  50.97 
 
 		 482 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  48.18 
 
 		 482 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  46.39 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  46.25 
 
 		 523 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  48.38 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  47 
 
 		 520 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  47.69 
 
 		 569 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  51.36 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  46.7 
 
 		 523 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  46.48 
 
 		 498 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  45.81 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  50 
 
 		 455 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  50.65 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  48.62 
 
 		 491 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  46.27 
 
 		 589 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  47.92 
 
 		 608 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  47 
 
 		 520 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  48.64 
 
 		 482 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  47 
 
 		 520 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  46.48 
 
 		 521 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  50.25 
 
 		 515 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  47.57 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  48.63 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  47.52 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  45.86 
 
 		 508 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  48.68 
 
 		 677 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  51.98 
 
 		 485 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  50.37 
 
 		 504 aa  422  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  48.58 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>