More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1989 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  100 
 
 		 309 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  72.13 
 
 		 308 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  70.29 
 
 		 313 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  66.23 
 
 		 302 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  68.09 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.06 
 
 		 308 aa  362  5.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  62.34 
 
 		 312 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  64.31 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  67.12 
 
 		 374 aa  347  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  59.62 
 
 		 308 aa  345  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  63.28 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.14 
 
 		 304 aa  323  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  58.72 
 
 		 319 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  57.05 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  55.34 
 
 		 314 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  58.82 
 
 		 338 aa  314  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  55.84 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  54.75 
 
 		 310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  54.75 
 
 		 310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  54.43 
 
 		 310 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  55.77 
 
 		 315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  56.27 
 
 		 313 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  57.05 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  49.35 
 
 		 311 aa  271  7e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  53.09 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  45.68 
 
 		 322 aa  262  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  46.46 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  50.62 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  45.1 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  48.84 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  44.26 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  43.79 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  41.16 
 
 		 305 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  45.28 
 
 		 302 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  47.71 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 		 305 aa  225  8e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  43.51 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  39.67 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  39.23 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  39.34 
 
 		 301 aa  219  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  43.89 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  47.04 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  37.01 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  41.56 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  42.31 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  44.74 
 
 		 314 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  39.16 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.95 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 301 aa  205  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  42.24 
 
 		 326 aa  205  9e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  46.6 
 
 		 254 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  42.05 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  40.06 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  44.34 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  42.31 
 
 		 330 aa  202  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  50.47 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  52.4 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  37.22 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.43 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.52 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.62 
 
 		 324 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  39.74 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  42.07 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  42.95 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  43.81 
 
 		 323 aa  192  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  40.59 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  52.5 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  45.07 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  42 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  43.05 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  41.2 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  37.58 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  42.49 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  48.74 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.96 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 280 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  38.61 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  36.86 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  39.6 
 
 		 319 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  50.9 
 
 		 317 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4993  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.49 
 
 		 349 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13320  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.22 
 
 		 241 aa  186  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  51.26 
 
 		 294 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  48.61 
 
 		 301 aa  185  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.26 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  41.58 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  39.87 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  41.69 
 
 		 741 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  38.99 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  37.58 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.03 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.44 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  37.65 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  37.1 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  38.92 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>