More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4437 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
1061 aa  2198    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  37.24 
 
 
1162 aa  451  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  63.92 
 
 
955 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  37 
 
 
1161 aa  418  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  50.64 
 
 
1600 aa  286  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  36.39 
 
 
1737 aa  224  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
486 aa  212  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.88 
 
 
810 aa  204  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 
878 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4803  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
438 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70984  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.97 
 
 
1694 aa  175  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5486  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
398 aa  174  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2165  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
579 aa  162  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  39.11 
 
 
327 aa  157  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
543 aa  156  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
1276 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.73 
 
 
632 aa  154  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
3172 aa  151  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
909 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 
927 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  31.88 
 
 
887 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  29.15 
 
 
676 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1745  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
406 aa  140  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
1486 aa  138  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2174  hypothetical protein  27.27 
 
 
404 aa  137  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.12 
 
 
573 aa  136  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
465 aa  135  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
3301 aa  134  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 
602 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.89 
 
 
816 aa  131  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
562 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.78 
 
 
725 aa  128  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
681 aa  128  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3904  hypothetical protein  28.95 
 
 
413 aa  127  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  29.45 
 
 
321 aa  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.93 
 
 
462 aa  124  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.51 
 
 
397 aa  124  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
685 aa  124  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.39 
 
 
764 aa  123  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.8 
 
 
818 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
448 aa  122  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
3035 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
4079 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.32 
 
 
1138 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
740 aa  119  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.8 
 
 
784 aa  118  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
505 aa  118  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
689 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
448 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 
617 aa  117  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.56 
 
 
707 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.73 
 
 
1022 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 
711 aa  116  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.39 
 
 
576 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
4489 aa  115  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.2 
 
 
1056 aa  115  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 
568 aa  114  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.48 
 
 
1979 aa  114  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.7 
 
 
622 aa  114  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 
1276 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  22.61 
 
 
564 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.24 
 
 
566 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
292 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
1094 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  27.11 
 
 
2059 aa  111  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.47 
 
 
1056 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.57 
 
 
865 aa  110  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
955 aa  108  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
789 aa  109  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.66 
 
 
565 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
828 aa  108  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
313 aa  108  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 
750 aa  108  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.27 
 
 
832 aa  108  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.56 
 
 
730 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
512 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  26.87 
 
 
1213 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
828 aa  107  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.52 
 
 
2240 aa  106  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.17 
 
 
1154 aa  106  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.63 
 
 
1007 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.21 
 
 
745 aa  105  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
1192 aa  105  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  27.25 
 
 
1056 aa  105  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  24.1 
 
 
714 aa  105  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.99 
 
 
988 aa  105  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
3145 aa  105  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
3560 aa  105  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
615 aa  104  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 
594 aa  104  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.25 
 
 
573 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 
391 aa  104  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
767 aa  104  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 
847 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
1049 aa  104  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 
566 aa  104  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  33.2 
 
 
314 aa  103  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3349  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
406 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0542169  decreased coverage  0.00718656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 
573 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.5 
 
 
620 aa  103  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>