18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1745 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1745  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 406 aa  825    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4803  glycosyl transferase group 1  51.13 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3904  hypothetical protein  38.58 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2174  hypothetical protein  35.81 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  33.89 
 
 		 1162 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5486  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2165  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 579 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 1061 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  34.48 
 
 		 1161 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3349  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0542169  decreased coverage  0.00718656 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 		 1297 aa  90.5  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3545  glycosyltransferase  23.2 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 1600 aa  63.2  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2750  hypothetical protein  27.75 
 
 		 736 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  21.58 
 
 		 1152 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  21.58 
 
 		 1152 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0543  hypothetical protein  25.39 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155137  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.01 
 
 		 916 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>