15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0543 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0543  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  880    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155137  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  42.73 
 
 		 1366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3231  hypothetical protein  35.71 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.2 
 
 		 916 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3349  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0542169  decreased coverage  0.00718656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2750  hypothetical protein  29.17 
 
 		 736 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 		 1297 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 1600 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4803  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2165  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.79 
 
 		 1161 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.75 
 
 		 1162 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5486  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1745  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2174  hypothetical protein  24.55 
 
 		 404 aa  43.5  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>