27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2174 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2174  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  836    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1745  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 		 406 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5486  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2165  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 		 579 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4803  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.46 
 
 		 1162 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 1061 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3349  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0542169  decreased coverage  0.00718656 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  28.3 
 
 		 1161 aa  116  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3904  hypothetical protein  26.87 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 1297 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3545  glycosyltransferase  24.79 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 1600 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.67 
 
 		 1366 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1061  glycosyltransferase  20.07 
 
 		 350 aa  49.7  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.37 
 
 		 916 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3992  hypothetical protein  25.52 
 
 		 325 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1755  hypothetical protein  31.52 
 
 		 358 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2509  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0251  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000777332  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.54 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3927  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.273461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 		 1152 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0543  hypothetical protein  24.55 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155137  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 		 1152 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  40.68 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>