16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3545 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3545  glycosyltransferase  100 
 
 		 391 aa  810    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 1061 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2174  hypothetical protein  24.79 
 
 		 404 aa  93.6  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2165  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 		 579 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4803  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 438 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1745  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  23.72 
 
 		 1161 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5486  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  24.81 
 
 		 1162 aa  66.6  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 		 1297 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3904  hypothetical protein  23.38 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  25.99 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3349  glycosyl transferase, group 1  21.68 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0542169  decreased coverage  0.00718656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 		 417 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  30.09 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>