More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3112 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 525 aa  1025    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  61.63 
 
 		 520 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  58.15 
 
 		 503 aa  555  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.81 
 
 		 532 aa  527  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.62 
 
 		 538 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.88 
 
 		 534 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.21 
 
 		 522 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.6 
 
 		 626 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.75 
 
 		 525 aa  315  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 533 aa  301  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.83 
 
 		 520 aa  293  6e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  41.39 
 
 		 507 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 		 528 aa  291  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  39.02 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 519 aa  286  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.19 
 
 		 519 aa  280  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 		 518 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 		 517 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 		 516 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 		 555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  36.42 
 
 		 562 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.45 
 
 		 537 aa  272  9e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 		 607 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 		 517 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 588 aa  269  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 526 aa  269  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 513 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  39.73 
 
 		 502 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  35.67 
 
 		 503 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6678  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 523 aa  267  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 539 aa  267  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 509 aa  266  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.9 
 
 		 478 aa  266  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 		 524 aa  263  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  37.77 
 
 		 535 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  41.05 
 
 		 521 aa  262  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  39.12 
 
 		 554 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.1 
 
 		 478 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.45 
 
 		 502 aa  260  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 584 aa  260  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 508 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 513 aa  259  7e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.7 
 
 		 522 aa  259  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.86 
 
 		 478 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.86 
 
 		 484 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 528 aa  256  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.83 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.83 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.83 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.83 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 		 521 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.83 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.83 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 509 aa  254  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 481 aa  254  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.62 
 
 		 488 aa  252  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.59 
 
 		 528 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.26 
 
 		 518 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 601 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  35.74 
 
 		 541 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 519 aa  246  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 517 aa  246  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 501 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.13 
 
 		 531 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 535 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.95 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 575 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 514 aa  244  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 529 aa  243  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 500 aa  242  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.76 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.02 
 
 		 525 aa  240  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1007  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 536 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1024  major facilitator superfamily transporter  35.58 
 
 		 536 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 490 aa  239  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 558 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.15 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 536 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1034  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 536 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 503 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  36.38 
 
 		 500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  36.29 
 
 		 505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 533 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 		 532 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 		 510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 540 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 532 aa  230  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  39.16 
 
 		 502 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.59 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 509 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 524 aa  228  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.38 
 
 		 534 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.92 
 
 		 509 aa  226  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>