More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0950 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  83.47 
 
 		 256 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  70.83 
 
 		 250 aa  350  8.999999999999999e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  73.08 
 
 		 255 aa  346  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  78.32 
 
 		 257 aa  344  8e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  70.59 
 
 		 455 aa  343  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  72.1 
 
 		 255 aa  341  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  69.2 
 
 		 252 aa  339  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  70.46 
 
 		 253 aa  338  4e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  71.86 
 
 		 268 aa  338  5.9999999999999996e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  70.46 
 
 		 280 aa  337  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  69.96 
 
 		 277 aa  335  5.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  69.49 
 
 		 255 aa  334  7e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  69.23 
 
 		 256 aa  332  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  72.69 
 
 		 445 aa  328  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  64.49 
 
 		 262 aa  327  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  68.22 
 
 		 258 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  67.22 
 
 		 258 aa  326  3e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  65.57 
 
 		 274 aa  322  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  65.95 
 
 		 266 aa  322  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  66.81 
 
 		 258 aa  321  8e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  65.55 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  67.24 
 
 		 264 aa  317  7.999999999999999e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  68.12 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  63.03 
 
 		 291 aa  317  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  65.13 
 
 		 271 aa  315  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  66.38 
 
 		 288 aa  315  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  63.37 
 
 		 259 aa  315  5e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  63.67 
 
 		 277 aa  313  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  62.13 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  63.49 
 
 		 255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  67.12 
 
 		 253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  60.26 
 
 		 279 aa  302  3.0000000000000004e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  66.22 
 
 		 250 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  62.88 
 
 		 261 aa  299  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  62.08 
 
 		 279 aa  295  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  67.65 
 
 		 258 aa  295  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  63.91 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  66.09 
 
 		 312 aa  291  9e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 247 aa  291  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  65.35 
 
 		 302 aa  285  5.999999999999999e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  65.8 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  61.6 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  57.98 
 
 		 252 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  54.92 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  57.14 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.36 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  58.77 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  56.43 
 
 		 245 aa  268  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  57.44 
 
 		 293 aa  268  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  58.4 
 
 		 257 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  59.49 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  58.44 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  53.39 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  53.5 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  59.07 
 
 		 241 aa  248  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  51.88 
 
 		 279 aa  240  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  52.65 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  57.5 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  50.23 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  55.66 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  53.88 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  51.16 
 
 		 228 aa  235  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  51.05 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  50.44 
 
 		 240 aa  231  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  52.75 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  51.61 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  51.74 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  57.21 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  46.82 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  52.44 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  48.4 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  54.75 
 
 		 247 aa  221  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  50.43 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.87 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.74 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  47.69 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  51.14 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.42 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  49.77 
 
 		 242 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0758  ABC transporter related  47.84 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0209945  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  51.12 
 
 		 245 aa  214  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  48.88 
 
 		 245 aa  214  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  49.37 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.98 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  45.7 
 
 		 229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 232 aa  212  5.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.69 
 
 		 226 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  43.36 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  51.72 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  46.15 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.61 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>