More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0028 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
247 aa  511  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  75.71 
 
 
247 aa  400  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  61.97 
 
 
243 aa  305  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  40.5 
 
 
217 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  44.07 
 
 
220 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  40.98 
 
 
217 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  40.98 
 
 
217 aa  151  9e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 
214 aa  148  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 
226 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 
235 aa  112  7e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  33.17 
 
 
222 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
225 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 
222 aa  84.3  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  30.66 
 
 
222 aa  82  7e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 
190 aa  80.5  2e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  32.52 
 
 
225 aa  80.1  3e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 
228 aa  80.1  3e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.27 
 
 
228 aa  79  7e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  24.48 
 
 
230 aa  78.6  1e-13  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  28.76 
 
 
230 aa  77.4  2e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  28.83 
 
 
230 aa  76.6  3e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 
223 aa  75.5  7e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  28.08 
 
 
389 aa  73.9  2e-12  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 
239 aa  73.9  2e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
227 aa  73.2  4e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  28.66 
 
 
195 aa  72.8  5e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  33.9 
 
 
184 aa  72.8  5e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  33.9 
 
 
184 aa  72.8  5e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  33.9 
 
 
184 aa  72.8  5e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
234 aa  72.8  5e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 
235 aa  72.4  6e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.01 
 
 
180 aa  72  9e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  30.12 
 
 
223 aa  71.6  1e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 
189 aa  71.2  1e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  33.05 
 
 
184 aa  71.6  1e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  33.9 
 
 
185 aa  71.6  1e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 
212 aa  70.5  2e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 
187 aa  70.5  2e-11  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 
188 aa  70.1  3e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  30.66 
 
 
237 aa  69.7  4e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  26.99 
 
 
231 aa  69.7  4e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 
239 aa  69.7  4e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  29.47 
 
 
227 aa  69.7  5e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 
189 aa  69.3  5e-11  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 
193 aa  69.3  6e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  32.2 
 
 
185 aa  68.9  7e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 
239 aa  68.6  8e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 
232 aa  68.6  8e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 
236 aa  68.2  1e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 
190 aa  68.2  1e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2011  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
204 aa  68.6  1e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  25.26 
 
 
190 aa  68.2  1e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 
211 aa  67.4  2e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 
187 aa  67.8  2e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 
203 aa  67.4  2e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 
223 aa  67.4  2e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 
211 aa  67.4  2e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
209 aa  67.4  2e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  30.82 
 
 
215 aa  67.4  2e-10  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  28.85 
 
 
213 aa  67.4  2e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  31.11 
 
 
216 aa  67.8  2e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  29.75 
 
 
240 aa  66.6  3e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  28.66 
 
 
247 aa  67  3e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  28.23 
 
 
231 aa  67  3e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  24.64 
 
 
224 aa  66.6  4e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 
189 aa  66.2  4e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 
236 aa  66.2  4e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  27.59 
 
 
359 aa  66.2  5e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
196 aa  66.2  5e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  31.87 
 
 
196 aa  66.2  5e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  35.51 
 
 
229 aa  65.9  6e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  33.04 
 
 
184 aa  65.9  6e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
196 aa  65.9  6e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 
230 aa  65.5  7e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  26.96 
 
 
234 aa  65.5  8e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  28.29 
 
 
231 aa  65.5  8e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1768  isochorismatase hydrolase  26.95 
 
 
207 aa  65.1  9e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470153  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  27.06 
 
 
184 aa  65.1  9e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
184 aa  65.1  1e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 
231 aa  64.7  1e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1834  isochorismatase hydrolase  26.95 
 
 
207 aa  65.1  1e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1787  isochorismatase hydrolase  26.95 
 
 
207 aa  65.1  1e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 
213 aa  64.7  1e-09  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  26.83 
 
 
233 aa  65.1  1e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 
221 aa  64.7  1e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 
216 aa  65.1  1e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 
233 aa  64.3  2e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 
191 aa  64.3  2e-09  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  30 
 
 
222 aa  63.9  2e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
196 aa  64.3  2e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 
227 aa  64.3  2e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  28.1 
 
 
196 aa  64.3  2e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 
231 aa  63.9  2e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  30 
 
 
222 aa  63.9  2e-09  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  25.91 
 
 
209 aa  63.9  2e-09  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  30 
 
 
222 aa  63.9  2e-09  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  26.96 
 
 
234 aa  63.5  3e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
228 aa  63.5  3e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  33.59 
 
 
210 aa  63.5  3e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  33.62 
 
 
190 aa  62.8  4e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>