More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0021 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  100 
 
 
705 aa  1423  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  46.02 
 
 
688 aa  529  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  46.04 
 
 
675 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  43.29 
 
 
678 aa  477  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  37.32 
 
 
691 aa  356  7e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 
731 aa  300  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 
694 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  2.81684e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 
681 aa  288  3e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 
680 aa  287  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  31.06 
 
 
706 aa  287  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  30.98 
 
 
706 aa  286  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 
706 aa  285  1e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  30.98 
 
 
706 aa  286  1e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  31.06 
 
 
721 aa  285  1e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  31.06 
 
 
706 aa  285  3e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 
715 aa  274  4e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.98793e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 
700 aa  274  4e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 
720 aa  273  7e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  29.78 
 
 
706 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 
700 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 
700 aa  272  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.15 
 
 
712 aa  271  3e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 
700 aa  271  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 
700 aa  271  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 
723 aa  270  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 
728 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 
700 aa  268  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 
697 aa  268  3e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.55766e-09 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 
700 aa  268  3e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 
705 aa  267  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  29.9 
 
 
700 aa  267  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  29.9 
 
 
700 aa  267  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  29.46 
 
 
710 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 
742 aa  266  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  30.07 
 
 
726 aa  266  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 
709 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 
701 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 
723 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  30.14 
 
 
743 aa  262  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 
736 aa  255  2e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 
681 aa  167  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 
742 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 
736 aa  158  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 
737 aa  155  3e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 
734 aa  147  8e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 
696 aa  147  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 
726 aa  142  2e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 
690 aa  141  4e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 
678 aa  141  4e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 
703 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 
791 aa  134  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  25.16 
 
 
727 aa  134  8e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 
791 aa  129  1e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 
688 aa  122  2e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 
700 aa  121  4e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  27.62 
 
 
712 aa  120  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  20.85 
 
 
701 aa  120  1e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  6.23394e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 
717 aa  117  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 
715 aa  117  9e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 
681 aa  117  1e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 
713 aa  116  2e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  25.04 
 
 
797 aa  115  2e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 
682 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  25 
 
 
757 aa  114  8e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 
776 aa  113  1e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 
770 aa  111  4e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  22.19 
 
 
762 aa  110  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 
776 aa  109  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  27.13 
 
 
680 aa  100  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 
698 aa  100  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 
780 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 
705 aa  97.8  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 
733 aa  97.4  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 
638 aa  97.1  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  26.23 
 
 
690 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 
718 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 
690 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 
688 aa  94.7  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  23.75 
 
 
711 aa  93.2  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 
769 aa  94  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 
700 aa  90.9  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 
712 aa  90.5  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 
778 aa  89.7  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 
757 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 
602 aa  89.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 
774 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  24.49 
 
 
716 aa  88.6  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  4.92197e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 
849 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  6.8938e-06  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 
735 aa  88.2  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  21.22 
 
 
730 aa  87  1e-15  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 
705 aa  85.9  2e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 
774 aa  86.7  2e-15  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  26.6 
 
 
692 aa  86.3  2e-15  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  23.64 
 
 
774 aa  86.3  2e-15  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 
626 aa  85.5  3e-15  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  23.64 
 
 
774 aa  85.5  3e-15  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 
626 aa  85.5  3e-15  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  23.64 
 
 
774 aa  85.5  3e-15  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  23.64 
 
 
774 aa  85.5  3e-15  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.22 
 
 
718 aa  83.6  1e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>