More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12471 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  65.43 
 
 		 1334 aa  687    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  68.4 
 
 		 1040 aa  775    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  83.28 
 
 		 961 aa  921    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  100 
 
 		 953 aa  1880    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  61.4 
 
 		 952 aa  667    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  65.31 
 
 		 1123 aa  764    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  60.96 
 
 		 1265 aa  675    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  62.87 
 
 		 1041 aa  651    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  69.79 
 
 		 1048 aa  654    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  66.67 
 
 		 1018 aa  637    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  66.21 
 
 		 1117 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  63.62 
 
 		 1043 aa  661    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  70.31 
 
 		 974 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  64.78 
 
 		 922 aa  653    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  65.82 
 
 		 1194 aa  664    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  64.46 
 
 		 944 aa  655    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  83.68 
 
 		 987 aa  930    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  66.7 
 
 		 1016 aa  946    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  63.02 
 
 		 990 aa  655    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  68.96 
 
 		 1093 aa  713    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  83.68 
 
 		 991 aa  930    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  58.47 
 
 		 1113 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  61.67 
 
 		 1080 aa  656    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  61.23 
 
 		 1151 aa  660    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  83.68 
 
 		 991 aa  930    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  61.86 
 
 		 1091 aa  632  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  63.51 
 
 		 1007 aa  634  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  65.71 
 
 		 1058 aa  634  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  64.12 
 
 		 1024 aa  633  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  66.05 
 
 		 1070 aa  633  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  65.7 
 
 		 908 aa  622  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  66.94 
 
 		 1244 aa  609  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  63.26 
 
 		 702 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  64.15 
 
 		 717 aa  591  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  59.42 
 
 		 1022 aa  555  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  59.42 
 
 		 1093 aa  551  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  47.27 
 
 		 457 aa  379  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  41.05 
 
 		 559 aa  301  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  40.57 
 
 		 494 aa  297  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  40.83 
 
 		 483 aa  297  6e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  40.52 
 
 		 564 aa  297  7e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  41.28 
 
 		 636 aa  296  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  39 
 
 		 492 aa  294  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  41.43 
 
 		 571 aa  293  8e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  41.81 
 
 		 483 aa  289  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  38.58 
 
 		 543 aa  289  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  38.77 
 
 		 562 aa  288  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  42.34 
 
 		 485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  40.82 
 
 		 489 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  42.34 
 
 		 485 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  37.47 
 
 		 496 aa  280  8e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  37.47 
 
 		 496 aa  280  8e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  40.79 
 
 		 416 aa  280  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  41.79 
 
 		 490 aa  278  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  39.71 
 
 		 411 aa  278  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  39.86 
 
 		 489 aa  277  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  39.86 
 
 		 489 aa  277  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  39.44 
 
 		 499 aa  275  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  39.76 
 
 		 495 aa  275  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  38.64 
 
 		 492 aa  275  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  38.66 
 
 		 497 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  40.44 
 
 		 496 aa  273  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  37.91 
 
 		 491 aa  273  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  39.76 
 
 		 495 aa  273  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  38.65 
 
 		 495 aa  273  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  38.17 
 
 		 503 aa  273  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  39.08 
 
 		 490 aa  272  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  38.8 
 
 		 501 aa  272  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  36.99 
 
 		 476 aa  272  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  39.14 
 
 		 1057 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  35.31 
 
 		 528 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  39.6 
 
 		 1012 aa  271  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  39.67 
 
 		 496 aa  271  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  41.79 
 
 		 485 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  39.58 
 
 		 531 aa  270  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  39.14 
 
 		 1073 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  41.79 
 
 		 485 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  41.79 
 
 		 485 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  39.67 
 
 		 496 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  36.92 
 
 		 1059 aa  268  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  36.67 
 
 		 1053 aa  268  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  36.08 
 
 		 487 aa  268  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  41.79 
 
 		 485 aa  268  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  37.77 
 
 		 489 aa  268  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  41.06 
 
 		 492 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1619  RNAse E  40.1 
 
 		 968 aa  267  5.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000868095  normal  0.696665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2193  ribonuclease  36.92 
 
 		 1111 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695078  normal  0.0536966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  37.85 
 
 		 503 aa  267  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5282  ribonuclease  35.39 
 
 		 1044 aa  267  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0972122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  38.1 
 
 		 1076 aa  267  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  38.32 
 
 		 496 aa  267  8.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  38.89 
 
 		 1128 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  40.26 
 
 		 1132 aa  266  1e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  35.53 
 
 		 528 aa  266  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  38.23 
 
 		 497 aa  266  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  38.64 
 
 		 1120 aa  266  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  39.64 
 
 		 1139 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  40.26 
 
 		 1132 aa  266  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0986  ribonuclease  36.92 
 
 		 1068 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1110  ribonuclease  36.43 
 
 		 1059 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000270139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>