202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2014 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  56.89 
 
 		 190 aa  187  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  56.89 
 
 		 190 aa  187  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  57.24 
 
 		 184 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  53.57 
 
 		 174 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  48.89 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  54.26 
 
 		 171 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  54.26 
 
 		 171 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  42.33 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  42.33 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  40.28 
 
 		 160 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  40.28 
 
 		 160 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  42.64 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  41.67 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  39.58 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2013  hypothetical protein  43.75 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.57132 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0417  hypothetical protein  35.81 
 
 		 165 aa  85.9  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03181  hypothetical protein  35.16 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  36.92 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  32.46 
 
 		 560 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  34.31 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2263  hypothetical protein  36.99 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.596766 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  34.59 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  28.23 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  35.78 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  34.75 
 
 		 435 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  35.29 
 
 		 457 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  29.29 
 
 		 441 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  35.94 
 
 		 439 aa  54.7  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  35.59 
 
 		 440 aa  54.7  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  35.45 
 
 		 442 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  35.59 
 
 		 437 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  33.11 
 
 		 434 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  32.28 
 
 		 440 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3233  WD-40-like repeat-containing protein  28.24 
 
 		 1048 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  34.45 
 
 		 1097 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  26.32 
 
 		 436 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  34.51 
 
 		 442 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  34.51 
 
 		 442 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  34.51 
 
 		 442 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  33.63 
 
 		 441 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  34.21 
 
 		 442 aa  52.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  31.71 
 
 		 450 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  32.59 
 
 		 434 aa  52.4  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  33.05 
 
 		 432 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.14 
 
 		 446 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  26.32 
 
 		 403 aa  52  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  36.67 
 
 		 428 aa  52  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  33.63 
 
 		 442 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  29.03 
 
 		 432 aa  51.6  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  33.63 
 
 		 442 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  33.63 
 
 		 442 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  33.63 
 
 		 442 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  33.09 
 
 		 441 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 451 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  32.33 
 
 		 440 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  31.34 
 
 		 445 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 439 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  30.53 
 
 		 438 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  33.59 
 
 		 441 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  32.82 
 
 		 421 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  33.64 
 
 		 474 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  32.43 
 
 		 434 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  34.04 
 
 		 432 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  27.27 
 
 		 444 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  30.82 
 
 		 1028 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  35.2 
 
 		 428 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3117  WD40 domain-containing protein  29.22 
 
 		 548 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000028868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  38.38 
 
 		 432 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  30.25 
 
 		 442 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 439 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  38.38 
 
 		 432 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  29.46 
 
 		 1202 aa  49.7  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.45 
 
 		 444 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  32.77 
 
 		 437 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  27.73 
 
 		 463 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  26.24 
 
 		 437 aa  49.7  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  35.25 
 
 		 427 aa  48.9  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  32.54 
 
 		 426 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  30.94 
 
 		 618 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  33.59 
 
 		 438 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  34.35 
 
 		 443 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  30.58 
 
 		 567 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  28.35 
 
 		 440 aa  48.5  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  31.82 
 
 		 442 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  34.35 
 
 		 440 aa  48.9  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  35.04 
 
 		 1059 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  34.4 
 
 		 432 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  33.59 
 
 		 437 aa  48.5  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  33.56 
 
 		 415 aa  48.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.37 
 
 		 422 aa  48.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  33.61 
 
 		 434 aa  48.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  31.37 
 
 		 422 aa  48.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  28.33 
 
 		 450 aa  48.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1021 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.53 
 
 		 438 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  27.42 
 
 		 441 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.93 
 
 		 442 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>