19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2263 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2263  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  338  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.596766 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0417  hypothetical protein  70.91 
 
 		 165 aa  241  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03181  hypothetical protein  66.67 
 
 		 133 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  36.99 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  33.55 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  35.56 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.86 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  31.69 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  32.64 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  32.64 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  30.5 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  29.63 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  35.48 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  28.45 
 
 		 441 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  32.43 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  29.37 
 
 		 421 aa  44.3  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  30.61 
 
 		 438 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  30.61 
 
 		 429 aa  41.2  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  29.7 
 
 		 443 aa  40.8  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>