More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1523 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  100 
 
 
191 aa  391  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  32.98 
 
 
165 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  36.65 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  33.68 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  33.87 
 
 
196 aa  92.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  33.85 
 
 
196 aa  91.7  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  28.72 
 
 
169 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  26.63 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  32.8 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  31.05 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  31.05 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  31.31 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  32 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.35 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  35.56 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  33.33 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.47 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.17 
 
 
166 aa  77.4  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  33.52 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  25.7 
 
 
345 aa  77  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.28 
 
 
186 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.43 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  31.94 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  31.41 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  28.14 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.22 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  27.66 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.22 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  31.16 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  27.27 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  26.78 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  28.99 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  32.62 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  26.5 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  27.59 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  26 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.28 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  32.29 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  32.76 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  25.53 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  30.1 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  25.82 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  25.62 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  26 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  31.21 
 
 
166 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.57 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.57 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  27.98 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  28.81 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  26 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  26 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  26.9 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  26 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.65 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  26 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2047  putative nitroreductase  31.18 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01399e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  29.24 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  26.77 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  31.21 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.23 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  29.24 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.94 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  25.5 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.81 
 
 
236 aa  67  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.61 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.26 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.72 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.5 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  29.19 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  26.47 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.96 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.33 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  28.06 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  25.29 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  36.11 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  28.14 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  29.41 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  30.99 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  27.59 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  27.6 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.41 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  31.84 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  25.14 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  30.48 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  29.26 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  25.86 
 
 
173 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  51.79 
 
 
227 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  25 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.12 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  24.14 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  25.14 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1643  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.51 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.462353  normal  0.0151841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.89 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  27.07 
 
 
278 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.92 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  28.32 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  29.1 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  25.26 
 
 
201 aa  61.6  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0115  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.07 
 
 
218 aa  61.6  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>